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    全基因组关联分析(GWAS)protocol

    全基因组关联分析（Genome-wide association study，GWAS）是应用基因组中数以百万级别的单核苷酸多样性（Single...

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  • 简短介绍下如何用GCE确定GWAS阈值

    GWAS大家都很熟悉了，随着目前越来越多的重测序文章的发表，可见如今SNP数据是非常的丰富，以及GWAS也发展了15年了，如今到了一个后GWAS...

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    群体DNA甲基化分析1——基因组各个组分相关统计

    写于20201114这部分，我是进行了基因组各个组分的一些统计。详细内容如下： 01.DMR和NSR在基因组中各个组分的占比 02.基因组各个基...

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    EWAS

    EWAS（Epigenome-Wide Association Study，表观基因组关联分析）其实就是用表观数据进行关联分析，目前用的最多的是...

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    使用pyGenomeTracks绘制表观展示图

    pyGenomeTracks是什么 首先在介绍pyGenomeTracks之前， 先说几个常用的表观组学数据展示工具，IGV，UCSC和Wash...

    1.5 6460 1 15
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    利用DMR进行PCA分析

    使用DMR进行PCA的主要目的是为了探究亚群中DMR是否存在大的差异，可以将不同亚群分开。因为我们知道DMR在植物中存在三种类型CG、CHG和C...

    0.4 2205 1 4
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    群体分布——如何用R语言绘制群体地理分布

    Nathan写于2020.08.15群体的地理分布，是做文章经常放的第一张图，其表明你的群体材料在地理上分布的情况（感觉是一句废话） 01 in...

    0.6 4118 0 12
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    使用OSCA进行eQTL分析

    Nathan写于20200807。OSCA（OmicS-data-based Complex trait Analysis）是杨老师2019年发...

    0.4 4141 2 4
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    Minimap2比对随笔

    Minimap2是李恒大牛在2018年开发的针对于三代测序数据进行比对的工具，minimap2的优势是速度快，而且听说比对的结果也比较不错，不知...

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