minimap2 我是用10G 以上基因组 +100G reads 默认参数下一般消耗20-40G 内存;存入文件时消耗80G 后来思考,-I 参数,对于一些大基因组 ...
我已经跑了orthofinder得到了orthologs,每个基因文件里都是蛋白序列,我怎么得到每个基因包含所有物种的核酸序列呢?
从参考基因组(序列)和SNPs(位点)入手的Ka/Ks(dN/dS)选择分析的基本思路流程Update Mar 9, 2023: 多物种寻找orthologs可以用OrthoFinder: https://github.com/davidemms/OrthoFin...
@hayes_L 你好!请问juicer2产生的文件里没有merged_nodups.txt,而是merged_dehup.bam和merged*.txt文件,应该如何生成merged_nohups.txt文件来作为3d-dna的输入mnd文件?
利用Juicer v2.0挂载染色体最近在搞基因组,前面contig的组装难度不大,用wtdbg2、raven、mecat2、flye等组装就可以了。 组装完毕后,contig挂载成染色体,可以采用高密度遗传连...
请问第4步怎么检查?能写详细点吗?
CentOS7 开机无法进入图形登陆界面问题:CentOS 7.3图形界面开机一直卡在该界面,无法进入登录界面。 解决方案: 1.开机后等待到下图界面,按上下键方向键停留在该界面 2. 选中第一项,按“e”进入编辑...
你好,可以把你的数据格式发出来吗?我照着你的代码试老报错
8. 群落结构差异显著性非参数置换的多变量方差分析(ANONIS)、相似性分析(ANOSIM)和多反应置换法(MRPP)常被用来评估不同采样点之间微生物群落组成差异的显著性。 一般来说,当我们通过降...