基因水平等于转录本水平的简单加和吗?例如计算TPM考虑了转录本长度,直接加和分母是不是不一致。从counts值出发做加和,然后对基因长度归一化更合理吧
汇总 | 转录本表达矩阵 到 基因表达矩阵写在前面 前天,我写了一个 TBtools 插件,意在让所有人都能自主分析转录组测序数据,进而获得 基因表达量矩阵(TPM) 和 基因读段计数矩阵(Count)。已经提过了,...
基因水平等于转录本水平的简单加和吗?例如计算TPM考虑了转录本长度,直接加和分母是不是不一致。从counts值出发做加和,然后对基因长度归一化更合理吧
汇总 | 转录本表达矩阵 到 基因表达矩阵写在前面 前天,我写了一个 TBtools 插件,意在让所有人都能自主分析转录组测序数据,进而获得 基因表达量矩阵(TPM) 和 基因读段计数矩阵(Count)。已经提过了,...
你这个韦恩图看着也太别扭了,本来就是两个集合取交集,你加个merge......
基因家族分析 | 基因家族成员鉴定(hmm模型&同源blast)方法一:基于hmm模型的鉴定方法 1.准备数据①下载拟南芥基因组fasta文件、注释文件gtf/gff3文件:ftp://ftp.ensemblgenomes.org/pub...
1、质量控制: 合并质控结果 Trimmomatic修剪去掉前端低质量碱基 2、比对到参考基因组(hisat2) 3、featureCounts计数(meta层面) 提取基因...