@zuby Mfuzz包自带的
Mfuzz的使用最近在进行ATAC和RNA-Seq的联合分析,由于处理的材料是时间相关的,所以time-course也是一个可以分析的点。在一位刘潜老哥的帮助下,我找到了一篇靠谱熊 转录组时...
我有时候会对DIffBind的输出结果进行下修改,然后放到deeptools-computeMatrix里面去。跟之前的HOMER一样,computeMatrix要求的也是b...
@三木_bc82 你这个数据集好像我一个也加载不出来……
一个不一样的NCBI下载方法之前在twitter上看见一个老哥开发了一个网站 sra-explorer,大致意思就是能够解析你输入的SRA号,比如说GSEXXX,SRPXXX,SRRXXX等(就是文章最...
@三木_bc82 我手机打开了下,没问题唉
一个不一样的NCBI下载方法之前在twitter上看见一个老哥开发了一个网站 sra-explorer,大致意思就是能够解析你输入的SRA号,比如说GSEXXX,SRPXXX,SRRXXX等(就是文章最...
所以我后来不用Gviz了……
我可能是最后一个知道IGV也可以overlap Track的之前一直非常眼馋Gviz的这个overlay功能。 因为我们做ChIP-Seq的时候,会有IP和Input。尽管我们可以在发文章的时候,在IGV上只放IP,但放上input会...
@要快乐_更要经历山河 额,我因为还没怎么弄懂Mfuzz,所以暂时放弃了软聚类这种方法。我现在一般是直接用R里面的Kmeans,那个我还有点懂……
Mfuzz的使用最近在进行ATAC和RNA-Seq的联合分析,由于处理的材料是时间相关的,所以time-course也是一个可以分析的点。在一位刘潜老哥的帮助下,我找到了一篇靠谱熊 转录组时...
你需要一台拥有公网IP的云服务器 第一步: 在服务器上下载code-server并安装。 第二步: 在服务器上运行code-server 除了在https://github....
我有时候会对DIffBind的输出结果进行下修改,然后放到HOMER里面去找motif。但我有个不太好的一点就是,每次都不记我的awk操作,导致我每次都得重新输一遍awk。于...
在前面的count normalization的方法部分,我初步介绍了一些常见的count normalization的方法,这部分我会写出对应的代码。用的数据集是我自己的一...
多亏了刘博😄
R_for_Data_Science_transform相关的题目感谢刘博出了一些针对R for data science_dplyr部分的题目。我稍微对刘博的题目做了改动,并做了对应解答。 不一定对╮(╯_╰)╭ 题目一 还是上一章节的 ...
有好几组处理和对照在的时候应该会很方便
我可能是最后一个知道IGV也可以overlap Track的之前一直非常眼馋Gviz的这个overlay功能。 因为我们做ChIP-Seq的时候,会有IP和Input。尽管我们可以在发文章的时候,在IGV上只放IP,但放上input会...
之前一直非常眼馋Gviz的这个overlay功能。 因为我们做ChIP-Seq的时候,会有IP和Input。尽管我们可以在发文章的时候,在IGV上只放IP,但放上input会...
转载请注明:陈熹 chenx6542@foxmail.com (简书号:半为花间酒)若公众号内转载请联系公众号:早起Python 今天介绍一个PDF实用的学习办公脚本: 多个...
的确挺有用的😄
R_for_Data_Science_Tibble&Import这是英文版的第9、10、11章 第9章是Introduction,没啥好讲的第11章import部分我一点都不熟,也没啥好讲的…… 10.2 Creating tibbles...
这是英文版的第9、10、11章 第9章是Introduction,没啥好讲的第11章import部分我一点都不熟,也没啥好讲的…… 10.2 Creating tibbles...
😂文抄公而已
count normalization的方法count normalization的方法 这应该会是一个小系列,我会简单介绍下现在的一些count normaliztion的方法,以及对应的代码解释、思考,从而最后得出...
count normalization的方法 这应该会是一个小系列,我会简单介绍下现在的一些count normaliztion的方法,以及对应的代码解释、思考,从而最后得出...
😳感谢老哥捧场
R_for_Data_Science_Script&EDA&projects这是英文版的第6,7,8章 6 Workflow: scripts 这章节其实没啥可说的,只是想起一篇文章,其中有一些小tips# 看了你安装的包installed.pack...
这是英文版的第6,7,8章 6 Workflow: scripts 这章节其实没啥可说的,只是想起一篇文章,其中有一些小tips# 看了你安装的包installed.pack...