免疫学硕士一枚～<br>生信热爱者但是小白一枚~<br>目前成就为0~<br>加油哦，一大波成就正在路上啦~<br>啾~猪莎要加油哦~
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geo中的数据都是count数据嘛？
如何判断你的GEO数据中的count值是否为log后的我下载了4个GEO乳腺癌的数据集，想要把它们整合为一个数据集，在获取了表达矩阵，提取了想要的数据，并且注释了探针名后，我想，终于可以整合了，然后，我就遇到了问题。除了其中一个...
感谢，记录一下，aes是组内比较，comparison是组间比较😃
R语言ggplot2添加统计学显著性用到 函数两种用法： 一、用aes函数映射 这个方法可以在组内进行比较 二、用comparison添加 这个只能在组间进行比较，comparison的赋值必须是x轴上的值“长...
用到 函数两种用法： 一、用aes函数映射 这个方法可以在组内进行比较 二、用comparison添加 这个只能在组间进行比较，comparison的赋值必须是x轴上的值“长...
今天用pRRophetic R包时发现不能用了，出现Error in if (class(testExprData) != "matrix") stop("ERROR: \"...
1.背景知识 在一篇文章里看到了微卫星不稳定性（Microsatellite Instability，MSI）与riskscore的关系图，就去查了一下，很好的背景知识资料：...
TIDE（http://tide.dfci.harvard.edu/[http://tide.dfci.harvard.edu/]）代表肿瘤免疫功能障碍和排斥，用于评估免疫疗...
免疫检查点的高低风险分组的基因表达情况可以针对这79个基因一同做比较吗，有的文章中的免疫检查点基因数量只有二十几个，是只选择了其中的部分进行吗🙏
【科研热点】免疫检查点相关基因前面小编跟大家分享过一些科研热点相关的基因集 ☞ m6A甲基化相关基因集[https://link.zhihu.com/?target=https%3A//mp.weixin...
如果将小于等于0的定义为nan，那如果数据中确实存在这样的值，之后处理过的数据不就会有很多nan值吗，那对于这些出来的nan值，是怎么处理呢，删去吗还是怎么
R语言实践二之数据预处理、探针ID转换、探针去重目标二：数据预处理，探针ID转换，探针去重1、数据预处理自动log2化，解释 以上代码在GEO官网可查。 2、探针基因名转换platformMap.txt中有常见的平台各R注...
那么出现的nan值要去掉吗
R语言中特殊值NaN、Inf 、NA、NULL前言：学习R过程中，数据中往往会出现一些诡异的符号，而不是数值，那么他们到底是什么意思呢？下面带领大家一探究竟。 (一) 特殊值的概念 1. NaNR中的无定义数用NaN表示...
想请教一下啊，如果像这样多因素回归的结果都大于0.05，那么还能用吗☺
单因素、多因素COX回归分析在R中的实现与常见问题解答在生信分析的过程中，单因素、多因素COX回归分析常用来筛选与患者预后有关的因素，相信很多小伙伴对此并不陌生。那么，如何在R中进行单因素、多因素COX回归分析？COX回归分析与...
ESTIMATE计算免疫基质得分以及肿瘤纯度 1.概述 Estimate根据转录组数据来计算免疫基质得分，也可得到肿瘤样本的肿瘤纯度 其原理本质上是先收集好免疫基因集和基质基...
生存分析只需要tumor数据，不要normal，将其去掉，谢谢，终于知道了
Kaplan-Meier生存分析的结果解读和绘制方法1. Kaplan-Meier生存分析 Kaplan Meier是一种单因素生存分析，它可用于研究1个因素对于生存时间的影响。参考：生存分析之Kaplan-Meier曲线都告...
1. Kaplan-Meier生存分析 Kaplan Meier是一种单因素生存分析，它可用于研究1个因素对于生存时间的影响。参考：生存分析之Kaplan-Meier曲线都告...
请问如果做单因素cox回归，是不是只选择肿瘤样本呢
基于R对TCGA患者临床数据整理和Cox分析一、数据整理 1 导入数据 利用data.table包导入数据，以LUAD为例 2 选择感兴趣的临床信息 一般常规项包括submitter_id，vital_status，t...
