@Alisa_1855 可以分享一下代码吗?
Transcriptional noise ratio(转录噪音比例)在一篇文章中,在研究young和old 的小鼠的过程中,提到了old的样本的转录噪音增加的问题。这篇文章的名字是《An atlas of the aging lung map...
@Alisa_1855 可以分享一下代码吗?
Transcriptional noise ratio(转录噪音比例)在一篇文章中,在研究young和old 的小鼠的过程中,提到了old的样本的转录噪音增加的问题。这篇文章的名字是《An atlas of the aging lung map...
这个香农熵应用到基因表达上能说明什么呢?
如何使用R计算香农熵?前言 1.1948 年,香农提出了“信息熵”(shāng); 2.信息量的度量就等于不确定性的多少。即:要搞懂一个非常非常不确定(gaoleng)的女孩(或是说我们一无所知的...
@小王的笑 https://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/Rfam/CURRENT/ 在databse里找一找
Rfam:small-RNA注释分类Rfam是用来鉴定non-coding RNAs的数据库,常用于注释新的核酸序列或者基因组序列。 infernal说明书:http://eddylab.org/inferna...
@软萌白甜Hedy icelogo
第8篇:用网页版工具做功能分析和motif分析上一篇介绍了使用ChIPseeker对peaks的分布和邻近基因的注释。除此之外,下游分析通常还包括鉴定我们感兴趣的蛋白质结合的motif;鉴定这些结合区域的基因以及这些基因...
museuploader_linux.py在哪里能下载到啊
超高速 | 使用 MuseTransfers 进行文件传输1. 扯淡时间[#%E6%89%AF%E6%B7%A1%E6%97%B6%E9%97%B4] 在追求高效的今天,会发现数据传输时常存在不高效的状态,如下图说明:你有A、B两台...
Xshell功能强大,在使用过程中,本人习惯它的黑底风格,所以一直用的Xshell,虽然好用,但很多人的xshell是在软件管家里下载的,或是不知道哪里有免费的,所以下载到了...
想不到有一天会自己抄自己。
一行代码解决GO富集分析柱形图David Kobas 富集分析的结果怎么转变为发表级别的图片?示例数据直接从网站导出整理成如下这种格式读入R
跟chip的流程没什么区别吗
MeRIP-Seq流程MeRIP-Seq流程图如下: 1 数据下载 注意事项:Aspera不能在root权限下安装,必须新增加一个普通用户才安装,一般安装在/home/user/下,安装完成后将下...
@caokai001 完全没毛病👍
雅卡尔指数 (Jaccard index)雅卡尔指数,或者称为交并比、雅卡尔相似系数,可以用于比较样本集的相似性与多样性。其定义为两个集合交集大小与并集大小之间的比例: 雅卡尔距离(Jaccard distance)...
挺厉害的 比我优秀好多 😊 突然感觉自己七年白上了😭
我的大学(下)信息管理1501 在大四的下学期,我在QQ邮箱实习。同组里也有一个来自我们学院的实习生。有一次我们偶尔闲聊的时候,聊到四年来的学习生活。他感慨了一句:“我觉得你们信管很厉害,...
@dicklim 解决掉了 感谢
200918 Circ之旅4.2-CIRIquantKevinzjy/ CIRIquant[https://github.com/Kevinzjy/CIRIquant]CIRIquant-cookbook[https://ci...
config.yml 具体要什么格式写啊 我照着他的说明书写频繁报错
200918 Circ之旅4.2-CIRIquantKevinzjy/ CIRIquant[https://github.com/Kevinzjy/CIRIquant]CIRIquant-cookbook[https://ci...
合并之后 junction reads里的那些NA怎么处理啊
子宫内膜癌circRNA数据分析(重分析)项目目的 CIRI2和CIRCexplore,2联合使用对数据进行circRNAs鉴定,并进一步做下游的差异表达等分析。 项目流程 1·tophat,BWA用于map到参考基...
我也得到了这样一张只有一条非常浅色的线的图 看其他的正常的结果中间都挺饱满的啊 这个是由什么原因造成的啊? 分辨率的问题?
HiCPlotterref:https://github.com/kcakdemir/HiCPlotter py2.7 python /media/shen/*/sun/biosoft/HiCP...
@坚持天天吃早餐 谢谢
ChIP-seq实践(H3K27Ac,enhancer的筛选和enhancer相关基因的GO分析)在实践之前,我先查找了一下有关组蛋白修饰的知识点:(参考文章://www.greatytc.com/p/8aca72809c5c) 组蛋白修饰能预测染色质的类型(异...
有没有什么途径能预测superenhancer呢
ChIP-seq实践(H3K27Ac,enhancer的筛选和enhancer相关基因的GO分析)在实践之前,我先查找了一下有关组蛋白修饰的知识点:(参考文章://www.greatytc.com/p/8aca72809c5c) 组蛋白修饰能预测染色质的类型(异...
LTR ERV的信息要在哪里找啊
「文献06」植入前胚胎的染色质可及性和转录组图谱日期:2019年2月9日——2019-Week6分类:「思路,方法」题目:An integrated chromatin accessibility and transcri...
挺厉害的 都是知识啊 学到了☺
火山图新画法整理思路:先画出中间的火山图,再画左右两张放大版的图,最后用AI将三张图拼接到一起,钢笔工具画出中间连接的小T形,同色的小矩形把连接处的实线盖住,打造出一种藕断丝连的神秘感(...