我们经常看到: 各步骤的解释及参数说明 1. NormalizeData() 作用: 归一化数据,调整不同细胞的测序深度差异。 默认参数解释:• normalizatio...
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为什么 FindVariableFeatures 要选择 2000 个基因? 在单细胞 RNA 测序数据中,不是所有基因对下游分析(如聚类、降维)都同等重要。FindVari...
什么是随机森林 随机森林(Random Forest)是一种由很多决策树组成的集成算法。可以简单理解为: 它的原理是将决策树的优点放大,同时降低单棵树的缺点(比如容易过拟合)...
什么是决策树? 决策树是一种类似“问答游戏”的工具,用来帮助我们从一堆数据中做出决策。它的核心是逐步提问,根据回答,最终把问题分解到一个简单的选择上。 通俗理解:就像玩“20...
@fbdddfc25b78 可以 什么问题
maSigPro 使用:maSigPro包中并没有直接叫maSigPro()的函数有谁是用过老版本的maSigPro之后来到这里的吗? 现在maSigPro包中并没有直接叫maSigPro()的函数。通常来说,该包中的关键功能函数是用来处理时序表达数据的,...
part1: 释义 在单细胞RNA测序(single-cell RNA sequencing)分析中,几个与细胞质量评估相关的关键指标,以及如何解读条形码(barcode)排...
在 shell 中使用 cp 命令时,可以通过 pv 或 rsync 命令来显示文件复制的速度和进度。cp 本身没有内建的进度显示功能。 方法 1:使用 pv(Pipe Vi...
利用docker容器进行metascape富集分析还是很简单的,默认分析human基因list,注意-S参数。 ps: 这里要特别注意!!! Introduction Met...
在Seurat中,FindAllMarkers函数是用来寻找不同群体(通常是细胞群体)之间显著差异表达的基因。这个函数对于解析细胞类型和理解细胞状态变化非常有用。FindAl...
WGCNA(Weighted Gene Co-expression Network Analysis)是一种用于分析基因共表达网络的方法。在WGCNA中,与基因表达量相关的一...
1. 设置环境 确保你已经安装了Python和Flask。你可以使用pip来安装Flask: 2. 创建项目文件夹 创建一个文件夹来存放你的项目文件。在项目文件夹中,创建以下...
背景知识与原理 1. PCA(Principal Component Analysis, 主成分分析) 背景:PCA 是一种经典的线性降维技术,起源于统计学和信号处理领域。它...
有谁是用过老版本的maSigPro之后来到这里的吗? 现在maSigPro包中并没有直接叫maSigPro()的函数。通常来说,该包中的关键功能函数是用来处理时序表达数据的,...
第十二章:命运交锋 赵枫和林月终于摆脱了迷雾,迎来了短暂的平静。然而,前方的道路仍旧充满未知的危险。就在他们以为可以稍作喘息时,一股强烈的不祥预感笼罩在四周,空气中似乎弥漫着...
第十一章:深渊召唤 经过与神秘女子的激战,赵枫和林月虽成功摆脱了险境,但两人的内心都感受到一种深沉的压力。这片森林不仅隐藏着未知的妖邪力量,还似乎与赵枫有着某种深层的联系,让...
使用 Shell 脚本或 Python 来检查和比较 MD5 值。这里提供两种高效的做法: 方法 1: Shell 脚本 Shell 脚本的执行速度较快,特别是用于简单的文本...
解决步骤: 检查 /tmp 目录使用情况首先,使用以下命令查看 /tmp 目录的使用情况:df -h /tmp这个命令会显示 /tmp 目录的磁盘使用情况,包括总空间、已用空...
第十章:妖异之森 赵枫和林月刚从迷雾的重围中脱身,眼前豁然开朗,一片光明的森林出现在他们的面前。然而,这片森林并没有他们想象中的那么平和。空气中弥漫着一股淡淡的异香,混合着一...
单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据分析中的质量控制(QC)是一个至关重要的步骤,旨在去除低质量的细胞,避免数据解读中的误差。其中,线粒体比例(mtDNA%)是QC中的...