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    day9-1 单细胞数据的二次分群

    day9-1 单细胞数据的二次分群 1.背景 Seurat里的FindClusters函数设置的resolution数值越大,分群的数量就越多,...

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    单细胞Day8-2-多样本拟时序

    1.导入数据 类似单样本,输入数据是seurat做完降维聚类分群注释的数据 但是table的时候每种细胞数目不一样 但是每个样本的细胞数和met...

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    单细胞Day8-1-单样本拟时序

    1.定义 做拟时序分析是为了探索自己感兴趣的几种细胞之间的发育关系,一般不是用全部类型的细胞来做的。以下是进行拟时序分析的几个主要目的:细胞状态...

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    单细胞Day7-多样本数据-2

    5.细胞类型注释 多样本的注释和单样本的是一样的。用的之前的自动注释 6.分组可视化及组间细胞比例比较 示例中:54 55 56是实验组,57 ...

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    单细胞Day7-多样本数据-1

    1.下载并整理数据 演示数据:GSE231920,3个treat+3个control 1.1字符串处理的函数 stringr包里的函数:str_...

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    单细胞Day6-marker基因和注释

    1.加载数据 直接加载之前的obj.Rdata 2.计算makergene 和差异基因里面的上调基因有点类似,某个基因在某一簇细胞里表达量都很高...

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    单细胞Day5-单细胞单样本数据的处理

    1.下载和整理数据 示例https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE231920...

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    单细胞Day4

    1.批量安装包 1.1 require和library 区别:(1)library 会在包没有安装时抛出错误,终止执行。require 会在包没...

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    连锁与交换

    连锁与交换定律 连锁(Linkage):同一染色体上的基因以及它们所控制的性状结合在一起传递的现象。交换(Crossing Over):减数分裂...