组学大讲堂

由于软件的功能限制，一些比对软件生成的比对文件，如Clustalx的*.aln文件，可读性差，无法满足高质量期刊的要求。因此，在实际操作过程中，需要对一些多重序列比对的文件进...

NiKasu

一、举例回顾 本节下载GSE1009数据集，使用limma包进行差异分析举例。 GSE1009 样本量：共6个样本，其中后3个为糖尿病肾病(DN)肾小球样本，前3个为正常肾小...

小洁忘了怎么分身

目前主流的免疫浸润计算方法是CIBERSORT和ssgsea，今天介绍CIBERSORT。 1.输入数据要什么 下面这段话摘自CIBERSORT的介绍 Importantly...

JamesMori

综合简书作者们的文章以及自己操作，综合整理如下，以备后面使用。有问题欢迎交流Robust enumeration of cell subsets from tissue ex...

Forest_Lee

简介 SRA是NIH的高通量测序数据的主要档案，是国际核苷酸序列数据库协作（INSDC）的一部分，包括NCBI序列阅读档案（SRA），欧洲生物信息学研究所（EBI）和DNA数...

Juan_NF

Let PCA tell us 容量有限，饮那瓢最能代表弱水的。 Then which？ 对待数据的正确态度-----处理之前，要先了解它(RNA-seq counts)RN...

生信小白出发啦

PCA in R 概述 PCA——primary component analysis 主成分分析。 PCA主成分分析可视化有多种方法，包括，。其中fviz_pca{fact...

纪伟讲测序

R语言的主成分分析（PCA）详解和带聚类的PCA图绘制 最近有个老师在整理文章数据，由于分组较多，想展示PCA图，说明不同分组的差异，公司默认给出的PCA图比较朴素，想做的好...