使用方法 1 下载基因组序列和基因组注释文件 大鼠基因组和注释文件:Rattus_norvegicus - Ensembl genome browser 105[http:/...
使用方法 1 下载基因组序列和基因组注释文件 大鼠基因组和注释文件:Rattus_norvegicus - Ensembl genome browser 105[http:/...
测试 显示报错: 提示找不到 libcrypto.so.3,重新安装openssl 提示不兼容 主要是和htslib不兼容,安装指定版本的htslib 再次测试 安装成功!!...
参考资料: Build a Custom Reference for Cell Ranger (mkref) - Official 10x Genomics Support[...
Cell Ranger需要在高配置的集群上才可以运行。将以下三个文件(解压后的Cell Ranger软件,测序数据,参考基因组)上传到服务器端。 核心命令 以下是提交作业的界...
1. 去除接头 1.1 fastp 1.2 cutadapt 2. 质控 3.spades组装
文件,脚本,将文件载入堆栈,选择文件夹,确定。 Shift+右侧选中载入的图片,编辑,自动混合图层。
参考: 使用 R 进行蛋白质组学数据分析 (bioconductor.org)[https://bioconductor.org/packages/release/data/...
安装 参考资料: Introduction of masstools • masstools (tidymass.org)[https://masstools.tidymas...
检出peak官方推荐参数 查看检出的features 上图中一条线(实际为矩形)代表一个离子,线的长度代表峰宽,宽度代表质荷比m/z的范围。图形不够美观,也不能带标记labe...
之前遇到过hisat2-align exited with value 134,这次遇到了137。屏幕显示报错: hisat2 log显示: 百度AI给出的解释是 hisat...
@1_2a9d ,这种的我还没试过,方便发一个测试一下吗?2018060369@nwafu.edu.cn
R package:xcms(一):导入数据导入所需要的包 1.单个样本 导入 提取基峰色谱图 2.多组数据 导入 提取基峰色谱图 参考资料: LCMS data preprocessing and analysis ...
定义分组颜色 tic这个函数用于计算每个样本所有保留时间内的总的离子强度(包括二级质谱),split用于将计算得到的总离子强度根据样本拆分为列表。 计算样品之间的相关性 bp...
导入一段DNA序列 设置窗口碱基的长度 计算GC含量 计算AT含量 可视化
如果我们想查看KEGG通路图,可以把kegg对应的通路保存为R脚本。点击命令行就可以打开。 还可以将上下调基因对应名称标红或标绿
参考资料: https://mp.weixin.qq.com/s/zCiZVxYR0HsglMVgJt9yNQ[https://mp.weixin.qq.com/s/zCiZ...