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    单细胞细胞比例分析方法列举

    1.利用箱线图比较两类样本的某个细胞比例差异 比较直观,但是缺点在于如果单细胞样本个数过少且异质性大,导致很难有统计学显著意义 2.R o/e 比值 好多文章都有用这个,我的...

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    monocle 2拟时序分析

    monocle做拟时序分析首先要构建CDS需要3个矩阵:expr.matrix、pd、fd,其次将Seurat中的对象转换为monocle识别的对象。然后选择想要做拟时序依据...

  • 利用BiocManager安装R包

    1.首先安装BiocManager包如果你的R版本为3.6版本,请将版本号设置为version = "3.11"version = "3.12"适用于R 4.0.0 2.通过...

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    单细胞转录组|Seurat 4.0 使用指南

    后台有读者翻到了一年前发的文献解读,请教了一下文章的图的做法。正好前段时间刚做过单细胞转录组分析,今天就给大家介绍一下常用工具Seurat的用法。 Seurat 4.0 使用...