Odds Ratios： 这里的odds ratios是事情发生与事情不发生的比先举个例子吧，若有两个人支持某球队赢，四个人支持球队输，那么支持赢的odds ratios =...
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Odds Ratios： 这里的odds ratios是事情发生与事情不发生的比先举个例子吧，若有两个人支持某球队赢，四个人支持球队输，那么支持赢的odds ratios =...
以下只用到了R中的ape包 1. 从BirdTree下载大量树文件 有Hackett和Ericson两种backbone。文献中见到的更多的是Hackett。 一个文件是10...
@生信小撰 学习了一下MK和HKA，应该都是需要种内的多态性信息，如果每个物种只有单个基因组应该做不了
从参考基因组(序列)和SNPs(位点)入手的Ka/Ks（dN/dS）选择分析的基本思路流程Update Mar 9, 2023: 多物种寻找orthologs可以用OrthoFinder： https://github.com/davidemms/OrthoFin...
近几年来，Hyphy的使用人数越来越来多，虽然不及paml，但这款软件的一些优秀特性使得它值得受到使用和关注。首先相比paml，hyphy有以下几大优点： 操作使用简单。 运...
REF: https://www.biochen.org/cn/blog/[https://www.biochen.org/cn/blog/] axtToMaf 处最终命名...
由于分析需求需要使用PhastCons分析DNA的保守序列，以及使用SIFT软件分析氨基酸变异的有害性，经过一段时间的探索，对这两款软件已经有了还算全面的认识，在此记录一下分...
写在前面：在上亿年的进化历程中，基因组经历了大大小小的改变。从小的核苷酸突变、插入、缺失到大的基因缺失、重复、基因组重排和水平基因转移。基因组比对可以通过比对序列中的同源区域...
1. 摘要 物种共存（species coexistence）是生物多样性维持研究中（maintenance of biodiversity）的焦点问题。物种共存可以是稳定的...
上次在介绍完功能强大的深度优先搜索算法(DFS)后，这次我来给大家介绍一下另一个功能类似且同样强大的经典算法——广度优先搜索算法 Breadth-First-Search（B...
写了一个景观生态学“斑块”统计的比较简单的递归算法，每次发现一个斑块（这里指考虑了标准化的正方形区域），向四个方向扩散并判断连接性，直到全部碰壁。然后把这些点放入列表里，避免...
创建database以后，进入data文件夹（也可以是用户自定义的那个文件夹） 修改两个文件：postgresql.conf 和 pg_hba.conf 1）postgres...
首先得有root权限。Centos 7上已经安装了postgres，后面需要把它停掉。 1）下载文件先安装依赖：https://www.postgresql.org/down...
https://www.investopedia.com/articles/trading/07/stationary.asp[https://www.investopedi...
https://explorablemultiverse.github.io[https://explorablemultiverse.github.io] 可交互的pape...
Data Leakage了吧
Python+GBDT算法实战——预测实现100%准确率原文地址：https://finthon.com/python-gbdt-prediction/-- 全文阅读3分钟 -- 在本文中，你将学习到以下内容： GBDT算法实现 ...
