热衷组培的二货潜

首先，一般我们分析水稻的数据时候，选用的是MSU和RAPDB这两个数据库的genome和gtf文件，这里只介绍MSU的ID，RAPDB的同理。 水稻GO分析的网站很多（这里不...

奔跑的Forrest

一、表型鉴定与记录的基本原则和原始数据处理 基因型分型基因型分型（英语：genotyping）是一个通过生物检定法检测某一个体的DNA序列，并对比参照其他个体的基因型或序列的...

奔跑的Forrest

先把GWAS系列课程看一遍，后面再把不懂的东西再补充上来 一、概念和理论基础 全基因组关联分析定义 是对多个个体在全基因组范围的遗传变异（标记）多态性进行检测，获得基因型，进...

奔跑的Forrest

一. 群体结构评估 1.群体结构 群体结构评估内容构建系统发育树群体结构分析PCA（主成分分析） a.系统发育树 一般 GWAS 都是种间的，用 NJ 法就可以，maga 就...

EwanH

基础理论 网络图 网络图非常常见，不仅被用在生物信息学分析，在生活中也很常见，如民航航线图、食物链、基因调控网络都是网络图经典的例子。 网络图应用价值 直观形象的呈现数据关系...

Wei_Sun

GS-MM散点图用于筛选hub gene，但是之前的图实在是有点丑，放在文章里好像有点拉胯，所以准备重新绘制。前期过程在专题（3）中已经介绍过了，这里只有后期优化。WGCNA...

PhageNanoenzyme

写在前面 简单来说，hub基因就是网络中节点连接的瓶颈基因，一个连接了很多节点的基因。这篇文章仍然来自几篇文章及自己平时的积累，主要阐述关键基因和hub基因。很多人误以为hu...