生物信息学分析和作图是科研狗们的必备技能。近几年,随着数据类型的增多,excel、SPSS等常用软件已经不能满足科研需求了。R语言以其方便、快捷的优势,迅速获得许多编程技术不...
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预测蛋白质结构PyMOL 蛋白质是生命活动的体现者,其结构决定着功能。由线性氨基酸组成的蛋白质需要折叠成特定的空间结构才具有相应的生理活性和生物学功能。 解析蛋白质的空间结构...
先来一张图,总结一下 蛋白质的结构描述 基因序列->氨基酸->组合表达成结构->氨基酸脱水缩合形成肽链,肽链折叠形成三级结构以后才能发挥作用。 蛋白质结构预测的原理 通过一堆...
MCScanX是检测基因共线性和进化分析的常用工具之一,2012发表至今引用数200+,作者之一的唐海宝老师是国内植物基因组学生信分析、软件开发领域的大拿,在学习使用MCSc...
MCScanX一般是做基因组之间的共线性 一、MCScanX安装 MCScanX官网http://chibba.pgml.uga.edu/mcscan2/#tm下载MCSca...
说在前面:官网http://chibba.pgml.uga.edu/mcscan2/index.php信息很全面,有示例代码/Manual手册,你值得拥有。以下内容基本出自官...
欢迎关注”生信修炼手册”! 在之前的文章中,我们提到利用网络聚类算法可以从复杂的蛋白质网络中挖掘蛋白复合体或者相应的功能模块,其中MCODE算法是最常用的挖掘蛋白复合体的算法...
上传DEGs gene_list到String 调整分析参数 然后下载tsv文件 同时下载图片 将前两列导入到cytoscape 导入到cytoscape 通过MCODE分析...