在2019年的一篇NG文章"Resequencing of 414 cultivated and wild watermelon accessions identifies ...
IP属地:贵州
在2019年的一篇NG文章"Resequencing of 414 cultivated and wild watermelon accessions identifies ...
写在前面 其实很多作者已经探索的差不多了,相关脚本、教程也很多,但我还是自己系统的总结一下吧。有时候感觉是浪费时间,但是在写的时候能发现并学习到很多新的知识,不断记录反思,也...
2022年7月,刘仁义团队(福建农林大学)和张兴坦团队(福建农林大学/中国农科院深圳农业基因组研究所)在Horticulture Research期刊(IF=7.291)发表...
本周阅读了文章 The Chicken Pan-Genome Reveals Gene Content Variation and a Promoter Region Del...
如何使用MUMmer比对大片段序列 测序技术刚开始发展的时候,大家得到的序列都是单个基因的长度,所以一般都是逐个基因的比较,用的都是BLAST或FASTA通过逐个基因联配的方...
分子层面对生物的研究,在个体水平上主要是看单个基因的变化以及全转录本的变化(RNA-seq);在对个体的研究的基础上,开始了群体水平的研究。如果说常规的遗传学主要的研究对象是...
0_1 前言 有时间再详细写introduction。先把我分析数据的流程记录下来,后续持续更新。 0_2 用到的软件或脚本 测序数据质控:fastp[https://git...
methylKit是一个用于分析DNA甲基化测序数据的R包,其核心功能是差异甲基化分析和差异甲基化位点/区域的注释。 1. 加载原始数据 DNA甲基化文件格式如下: 每一行是...