催更!😛😛
MySQL一些我不熟悉的技巧1. 插入数据 简单插入数据 批量插入数据 insert ignore into table [(cols)] # 检查数据,如果有重复的数据则忽略插入的数据 replace...
参考: R语言第二章数据处理③删除重复数据果子学生信 1.保留第一个重复: A,A,B,C --->A,B,C2.去掉所有重复:A,A,B,C --->B,C一般情况函数默认...
缘起:今天想尝试在vs code中使用python,出现了几行warning,大意是conda无法激活。 总结经验: Anaconda可以看作是一个虚拟机,我们的python...
愚人节快乐。 导入数据,设置选项 hESCs vshiPSCs 注释文件路径 告诉软件测序数据是哪个平台的数据 测序数据路径(450K:idat文件) 选择option pr...
前言 众所周知,当你所自己今年比去年更优秀的时候是不可以随便吹牛的,请把你在简书上发文的频率以及质量摆出来! 面对今年和去年的数据,或许你需要一个统计检验的方法... 组间差...
@Christophe_0c1f https://gtexportal.org/home/datasets@Christophe_0c1f https://gtexportal.org/home/datasets这个网址下有一个GTEx_Analysis_v8_Annotations_SampleAttributesDD.xlsx文件,可以下载来看一下
复盘总结(三)GTEX表达矩阵预处理 R语言学习:1.append添加新的列。2.R语言处理大规模数据速度不算快,通过安装其他包比如data.table可以提升读取处理速度。fread比r...
下载注释文件(以hg19为例) 下载gene_id相互对照文件 UCSC上的注释文件还是非常全面的,clade选择大的分支,genome选择物种,assembly选择基因组对...
[lt@localhost ~]$ java -version Error: dl failure on line 597 Error: failed /data/home/...
今天做展示PPT的时候发现可以用一种更简单的方式计算之前计算过的内容,因此更新一下之前的结果。1.相关性分析结果 2.组织特异性甲基化的启动子区域 得到2006个组织特异性甲...
特异性分析 得到1495个组织特异性的启动子甲基化区域。(由12118个启动子甲基化区域得到)不重复的基因只有1392个,有一些基因在不只一个组织中,也有的基因在组织中重复出...
GTEX表达矩阵预处理 R语言学习:1.append添加新的列。2.R语言处理大规模数据速度不算快,通过安装其他包比如data.table可以提升读取处理速度。fread比r...
接复盘总结(一) methylkit R包上游处理 对甲基化位点进行注释、导出SPM分析上游文件 几点说明:1.启动子区域的选取:上下游250bp,参考文献中做法。当然也有选...
新年最适合干什么?当然是复盘总结!!先从代码开始复盘。 linux处理bed文件 用linux不多,还是一开始尝试上游分析(测序数据的质控、比对)的时候用的比较多。linux...
生信人的20个R语言习题 1.安装一些R包: 2.了解ExpressionSet对象,比如CLL包里面就有data(sCLLex) ,找到它包含的元素,提取其表达矩阵(使用e...