发简信
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学习目标： 学会用MACS2 call peaks 理解MACS2 call peaks的结果 Peak Calling Peak calling即利用计算的方法找出ChIP...
放在最前面的参考链接：给学徒的ATAC-seq数据实战（附上收费视频) 数据来源的文章： The landscape of accessible chromatin in m...
call SNP GATK bwa+samtools 参考文档 一、原始数据处理 测序得到的RAW DATA，使用NGSQCToolkit进行过滤$PATH/Il...
当师兄和老师就应该选取哪一个相关系数讨论时，我发现我插不上话。这对于具有话痨体质的我，怎么能忍？为了能在组会上多喷几句，我写下了这篇文章…… 太长不看系列 线性关系使用Pea...
GTF与GFF文件都是用于存储注释信息的文本类型，经常可以看到二者格式之间的相互转换。二者的名字相似，连内容都极为相似，那么二者的差异究竟在哪里呢？ GFF (general...
清华镜像近日发布了一条关于停止Anaconda镜像服务的通知，很不幸，在此之前我一直使用的是清华镜像源，于是可怜的我只能另觅它法…… 如果你不知道自己的anacon...
虽然是做生物信息的，但是经常被一些基础性概念所困扰……而我又是一个强迫症，于是把这些乱七八糟的东西整理了一下，强行写了一篇小文章。东西太杂，但是彼此相关，实在想不到什么合适的...
在NGS分析入门阶段，我们不需要考虑太多的细节，只用知道一个分析的大致流程并完整跑下来即可。太多的细节，只会让我们对于分析产生莫须有的恐惧，因此一些“无关紧要“细节就被我们刻...
python代码工具我在用的有： python shell pycharm sublime text jupyter notebook 桌面功能多的还是sublime tex...
加载并处理数据 针对临床资料某一因素，如年龄，性别等进行生存分析，并画图 针对基因的生存分析：方法一：挑选感兴趣的基因做生存分析 针对基因的生存分析：方法二：批量生存分析 使...
刘小泽写于19.7.5-第二单元第七讲：每个细胞检测到的基因数量差异 笔记目的：根据生信技能树的单细胞转录组课程探索smart-seq2技术相关的分析技术课程链接在：http...
