假设检验: 一般步骤: 1.设定假设后需要验证:假设0一般都是“处理组和对照组无区别” 2.构建检验统计量:根据样本数据计算统计量和检验统计量 3.设定置信区间:根据检验统计...
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最近用limma作差异分析,接触p.value和adj.p.value比较多,今天就重点解释下p.value和FDR吧: 在topTable函数的结果里,我们都会看到p.va...
我的R在版本由4.2.2更新4.3.1后使用remotes::install_github("YuLab-SMU/HPO.db") BiocManager::install(...
很久很久以前,看到过文章中的KEGG富集可视化结果图。是对KEGG通路进行注释的。后来在一些测序公司的宣传页上也见到过类似的图: 其实这个图就是多了一个KEGG通路注释,近期...
做临床数据分析的时候我们经常会用卡方检验或者Fisher精确检验去看看不同的临床特征在两组里面有没有显著差异。今天小编就带大家来重现一下下面这篇paper的Table2 Ta...
问题链接看http://www.bio-info-trainee.com/4458.html 我碰到的问题 1.要不要把每个list变成data.frame,我给变成了,我首...
GEO数据库 mRNA芯片分析全流程 我们演示的数据集是GSE19136,样本可分为三组(对照组,支架组,紫杉醇组),具体实验设计情况请查看链接。本篇文章主要对对照组和支架组...
前面简单给大家介绍过 GEO数据库数据检索方法(一)[http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI4ODE0NTE3OA==&mid=2649210...
莎莎写于2020.5.7✍今天上午10点钟准时就醒了,然后和室友磨叽半天去实验室打扫卫生,然后签了字就偷偷溜了😄然后回到中校区买了超级甜的哈密瓜🍈还有火龙果,沃柑,一共是30...