导读 PICRUSt (Phylogenetic Investigation of Communities by Reconstruction of Unobserved S...
导读 PICRUSt (Phylogenetic Investigation of Communities by Reconstruction of Unobserved S...
资料来源 首选看这个,可以跟着手操一波小分子的下载和软件的使用(主要录制的比较好)【虚拟筛选】使用Autodock_vina进行批量分子对接_哔哩哔哩_bilibili[ht...
看文献偶然发现一位大神,简直是行走的SCI机器。下面就来逐渐学习下这位大神的文章。 首先来学习这篇近期发在预印本上的生信文章: 题目: 1.整体思路 2.结果解读 2.1 高...
TCGA学习01:数据下载与整理 - 简书 TCGA学习02:差异分析 - 简书 TCGA学习03:生存分析 - 简书 TCGA学习04:建模预测-cox回归 - 简书...
R语言直接上代码参考文章一[https://www.r-graph-gallery.com/14-venn-diagramm.html]参考文章二[http://blog.s...
============================================写在前面:可以参考另外一篇《得到差异基因后怎么做?[https://www.jians...
QIIME2功能介绍 1、数据导入 示例 2、生成OUT表 示例 3、操作特征表 特征表统计 过滤特征表:过滤样本 4、多样性分析 核心多样性(无系统发育树) alpha多样...
这个步骤推荐在R里面做,载入表达矩阵,然后设置好分组信息,统一用DEseq2进行差异分析,当然也可以走走edgeR或者limma的voom流程。基本任务是得到差异分析结果,进...
要说寻找公共芯片测序数据大家都知道上 GEO 查找,其实 EBI 也有个叫 ArrayExpress 的网站(网址ArrayExpress < EMBL-EBI)托管了大量的...
相信很多科研工作者(不包括比我厉害的大佬们)在做转录组时,都是在公司做测序,然后数据也交给公司分析,又然后,期待做个差异分析,得出像下图那么完美的热图。 然而,然而,,我们得...
1蛋白的pdbqt准备 包括加氢、计算电荷、添加原子类型打开AutoDockTools,菜单栏File->Read Molecule,选择蛋白的pdb文件,点击打开。 pdb...
1.Grid (1) 打开蛋白,“Grid->Macromocule->Open”,打开“r.pdbqt”。弹出的对话框,点击Yes及确定 (2) 打开小分子,“Grid->...
用于TCMSP 找不到的目标中药的补充。参考:中药复方网络药理学:9. 1 TCMSP找不到目标中药怎么办?(一) 原则 1)进行靶点预测时,不要将TCMSP 数据库与其他数...
下载TCGA数据时,可以采用多种方式进行下载,有使用R 相关的packags进行下载,最新的数据最好是从TCGA官网进行下载。 1.使用官网网页进行下载 如果需要下载的数据量...
参考学习的课程:解螺旋-酸谈学社-体系课-二十四型 解螺旋
clusterProfiler: universal enrichment tool for functional and comparative study(Y叔) 1 总...