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    脑转移癌相关髓系细胞

    大脑很久以来都被认为是一个免疫豁免器官,其含有的免疫细胞含量较少,但在一些病例情况下,例如肿瘤,就会导致免疫细胞的异常浸润,其中从血液中迁徙过来...

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    脑部肿瘤的免疫微环境图谱

    2020年,来自瑞士洛桑大学的Johanna A Joyce团队通过全面对比不同类型肿瘤的免疫微环境,展现了不同类型脑肿瘤的免疫浸润特点,回答了...

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  • GATK下游VCF maf可视化

    VCF可以通过不同的上游分析获得,在格式上又有一些不同,盲目转化会带来很多问题。查看VCF文件内容可知是通过GATK上游处理得到的。 为了对变异...

  • RNA seq上游分析(简洁版)

    环境配置 质检 去接头 比对 得到count值 最终会在目标文件夹下面获得两个文件,counts.txt和counts.txt.summary。...

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    单细胞测序揭示巨噬细胞和小胶质细胞动态竞争关系

    今天介绍一篇有关于单细胞揭示在胶质母细胞瘤中,大脑原位的髓系细胞(小胶质细胞)和血液来源的单核-巨噬细胞的动态竞争关系。 背景 免疫检查点抑制剂...

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    非小细胞肺癌微环境免疫模式用以肿瘤分型和病人分层

    2021年,Leader等人通过目前最大的非小细胞肺癌的单细胞测序和CITE-seq,对非小细胞肺癌的微环境进行了多组学的分析,最终构建了一个包...

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    乳腺癌骨转移微环境辅助精准治疗

    最近看到一篇单细胞与临床相结合的文章,通过乳腺癌骨转移的肿瘤微环境,提示肿瘤的精准治疗。发表在Ann Oncol. 作为一个临床医生,本文的实验...

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    GSE120974多组学分析复现

    0.数据介绍 这是一篇发表在Cancer Cell 2019 Sep的文章——Single-Cell Transcriptomics in Me...

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    001-单细胞时序性追踪探究肺癌中PD-1疗法对耗竭T细胞的效应

    本文是北大张泽民教授团队2022年的新作,通过T细胞谱系追踪的方式,探究PD-1疗法对于肺癌中免疫微环境的影响。 背景 免疫检查点抑制剂通过阻滞...