高通量测序又称NGS,重新定义了基因组学研究。近年来,NGS技术稳步发展,伴随着成本下降以及测序应用呈指数增加。本文,我们研究了影响测序文库质量的关键因素,以及,在DNA来源...
高通量测序又称NGS,重新定义了基因组学研究。近年来,NGS技术稳步发展,伴随着成本下降以及测序应用呈指数增加。本文,我们研究了影响测序文库质量的关键因素,以及,在DNA来源...
目前单细胞测序获取细胞的方法主要有两种:(1)Smart-seq:测序细胞量少(因为一次通过一个细胞),但是测序的reads数多;(2)Drop-seq(10X ):可以测许...
1.文件读取与写入 with open(somefile) as f,是比较推荐的读取文件时的字段,可自动关闭文件,避免因为程序崩溃未及时写入; 内置函数readlines,...
磕磕绊绊基本学明白了R,现在用python下载和处理(文件名对应TCGA barcode),主要是通过任务带一下自己对python的学习; 准备说明 一共3个脚本,分别为va...
下载notehighlightReleases · elvirbrk/NoteHighlight2016 · GitHub[https://github.com/elvirb...
最近搜到GSE21653,提取临床信息部分,发现,多个行出现了,列之间串掉了; 本来是把整个下载到的.gz文件解压后,在txt部分作了更改,但发现串的行数还挺多的;觉得,gr...
时间有点久了,我没有太注意哈
硬着头皮往下走PCA|GSEAPaper:Tumor Evolution and Drug Response in Patient-Derived Organoid Models of Bladder C...
用github上的包,一直报错。安装也报错了,下载安装包后,手动进行了安装;示例数据在github上,就一直报错。话不多说,上解决方案。 情境 环境:Windows 7,无法...
1.R里的字符串提取 还是要对正则表达式多少了解一些regexpr和regmatches搭配使用,regexpr定位字符串中的指定模式的位置和对应字符数等信息,regmatc...
版本问题 DecisionCurve装包失败 包名已改为rmda 报错na.delete function;安装Hmisc包解决;
最近 Windows 用的很多,经常看到各种乱码文字,让人看不懂意思。 比如在构建 R 包时: 当然这里影响不大。但如果是一些重要的报错信息,那可就不行。 所以建议还是使用英...
1。首先去下面的这个网站http://software.broadinstitute.org/gsea/msigdb/collections.jsp#C3 2.下载tft文件...
如果R下载网速不快,可以考虑wget -c下载压缩包;1)现在windows10 应用商城有ubuntu的可兼容版本,适用了下,很好用;2)git版本,git bash he...
以下用大量截图展示 1.不明觉厉 The STRING database in 2017: quality-controlled protein–protein associ...
1.for 与 png() for and png 对富集到的结果用goplot展示,又想把BP、CC、MF分开进行绘制;于是用for循环进行,但每次的图都是空白;需要在pn...
computeGCbias 网页介绍很详细: https://deeptools.readthedocs.io/en/develop/content/tools/comput...
fastq1和fastq2特定的cluster的序列 @SRR8980088.3 fastq的identifier基于此可以找到下机数据中该编号对应的序列; fastq在SA...