十月文献阅读记录 文献阅读一 Current best practices in single-cell RNA-seq analysis: a tutorialMalte ...
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Seurat 没你想的那么简单||Comprehensive integration of single cell dataCell 深度| 一套普遍适用于各类单细胞测序数据集的锚定整合方案 这篇文章说的不是别人,正是Seurat本尊。它正在打破自我的标签,只能做单细胞转录组?只能做CCA寻找共有...
刘小泽写于18.7.20https://hemberg-lab.github.io/scRNA.seq.course/index.html 介绍 Bulk RNA-seq: ...
刘小泽写于19.6.17-第二单元第三讲:熟悉文献作者提供的两个表达矩阵 笔记目的:根据生信技能树的单细胞转录组课程探索smart-seq2技术相关的分析技术课程链接在:ht...
Seurat使用教程(v3.0) Seurat是一个分析单细胞转录组数据的R包,用于QC,分析和探索单细胞RNA-seq数据,相关资料如下: 参考教程测试数据 具体流程如下:...
大多数人推荐Linux,基本上都会说Linux让你更高效、更优秀。 然而工具只是工具。 然而工具只是工具。 然而工具只是工具。 优秀程序员和不优秀程序员的区别首先是态度上的区...
得到测序文件进行比对后经常需要对bam文件进行覆盖深度、靶向捕获效率的统计分析进行初步质控。这里介绍一个输出结果比较多的软件bamdst,bamdst可以一次性输出包括深度、...
首先,使用ALLbio软件下的breakdancer2vcf.py转化breakdancer得到的out文件GitHub地址:这里代码如下: 复制代码或者github clo...
说明:仅根据官网指南加个人理解,相应图片参考官网(目前官网上最新的Tutorial已经更新成Seurat3.0版本,下面的流程是2.4版本,有些许出入。新版本将会在2019年...