看论文 Genomic insights into the origin, domestication and diversification of Brassica jun...
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1.选择信号分析—Fst选择信号分析 概念 Fst:群体间遗传分化指数,是种群分化和遗传距离的一种衡量方法,分化指数越大,差异越大。适用于亚群体间多样性的比较。 用于衡量种群...
基本概念 Fst:群体间遗传分化指数,是种群分化和遗传距离的一种衡量方法,分化指数越大,差异越大。适用于亚群体间多样性的比较。用于衡量种群分化程度,取值从0到1,为0则认为两...
SURVIVOR 软件的功能: 1)Simulate SVs and evaluate existing callers.2) Merge and compare SVs w...
现在有syri生成的vcf变异文件分布在每个文件夹里,提取每条染色体的变异数目。 脚本: 使用a.txt 画图,将数据读入R中, 绘制箱型图, 哎,写毕业论文去了
一、聚类 1.准备工作 (1) 研究目的 聚类分析是根据事物本身的特性研究个体分类的方法,聚类分析的原则是同一类别的个体有较大相似性,不同类别的个体差异比较大。 (2) 数据...
在群体遗传学中衡量群体间的遗传分化的程度的指标有许多种,较为常见的就是遗传分化指数(Fst),fst是由F统计量演变而来,F统计量主要有三种(FIS,FIF,FST)。Fst...
01 非人灵长类动物单细胞转录组和调控组参考图谱绘制完成 非人灵长类动物在遗传、器官结构、生理功能、病理反应和生化代谢等诸多方面都表现出与人类相似的特征,其中食蟹猴已经成为医...
在处理ChIP-seq数据的时候,遇到这样一个问题:前期我的FASTA和GTF文件中染色体的名字是1,2,3......22这样的,但后期某些分析过程要求染色体名称必须以ch...