开干 #运行包 library(ggplot2) library(readxl) library(dplyr) #读表，%>%是dplyr包里面的 data <- read_...
发简信
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开干 #运行包 library(ggplot2) library(readxl) library(dplyr) #读表，%>%是dplyr包里面的 data <- read_...
文章来源：中国科学院大学生态环境中心土壤生态过程与生态重建研究组陈保冬研究团队 摘要 土壤铬污染是全球关注的环境问题。然而，生物炭和AM真菌接种物联合应用对植物抗铬性的影响尚...
我不记得了，好像没有用过
Gephi | 共现网络使用自己固定的颜色Gephi在绘制微生物共现网络图的时候一般只能固定使用网络的属性进行染色，每次的OTU节点染色的时候都会随机生成颜色，无法做到多个颜色的统一，这篇文章可以解决固定染色的问题。...
摘要 根系相关微生物在植物对环境胁迫的响应中发挥着重要作用。然而，控制盐胁迫植物与微生物之间相互作用的潜在机制却知之甚少。该研究通过聚焦耐盐植物野大豆(野生大豆)，证明了以假...
准备阶段 安装VennDetail包，首先需要安装BiocManager包 if (!require("BiocManager", quietly = TRUE))#确认是否...
基因的表达是dna-rna-蛋白,期间有转录水平调控、转录后调控、翻译后调控等多种调控机制影响该基因的表达. 所以蛋白水平高低的原因就可能是多方面的.蛋白表达多,可能是mrn...
@小茞 degree是度，表示与某个节点直接相连的边的数目，是网络拓扑性质，主要看这个节点在这个网络中的重要性，有些网络绘图会用这个来表示节点的大小，这是我的理解
Gephi| 改变节点形状这边文章主要是针对Gephi中的节点一直为圆，无法更改形状的问题，这个导出的图为png会显示节点，PDF和SVG文件都没有办法显示节点，主要是因为添加的插件 Polygon ...
数据用的是KEGG的L2级的分类相对丰度 长这个样子，柱状图的x轴，第一列是命名，第二列是分类，第三列是相对丰度 安装包就不解释了，直接读取，安装包的过程可以看其他的，这几个...
这边文章主要是针对Gephi中的节点一直为圆，无法更改形状的问题，这个导出的图为png会显示节点，PDF和SVG文件都没有办法显示节点，主要是因为添加的插件 Polygon ...
Gephi在绘制微生物共现网络图的时候一般只能固定使用网络的属性进行染色，每次的OTU节点染色的时候都会随机生成颜色，无法做到多个颜色的统一，这篇文章可以解决固定染色的问题。...
ggplot2包的目的是提供一个全面的、基于语法的、连贯一致的图形生成系统，允许用户创建新颖的、有创新性的数据可视化图形。 1、简介ggplot2语法 下面将从一个例子来看看...
library(permute) library(lattice) library(vegan) otu <- read.delim('D:/Adata/First/otu....
#运行ggplot2 library(ggplot2) #读取数据 library(xlsx)#导入xlsx或者xls文件，其他文件不需要 workbook<- ("D:/A...
论文 Microbiome differential abundance methods produce different results across 38 datase...
