1.在任意文件夹下面创建形如 1/2/3/4/5/6/7/8/9 格式的文件夹系列。 2.在创建好的文件夹下面，比如我是/Users/jimmy/tmp/1/2/3/4/5/...
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1.在任意文件夹下面创建形如 1/2/3/4/5/6/7/8/9 格式的文件夹系列。 2.在创建好的文件夹下面，比如我是/Users/jimmy/tmp/1/2/3/4/5/...
上次我们整理到bwa比对后得到bam文件，下一步我们要通过GATK流程从bam文件中call variant。 一、使用GATK前须知事项： 对GATK的测试主要使用的是人类...
利用clusterProfiler进行富集分析时，发现网上没有物种包OrgDb，利用网上教程构建了一个。主要参考了刘小泽的简书，特别感谢一下！！！ emapper首先得到注释...
刘小泽写于19.1.20-21要进行GO或者KEGG富集分析，就需要知道每个基因对应什么样的GO/KEGG分类，OrgDb就是存储不同数据库基因ID之间对应关系，以及基因与G...
1. 在Rstiduo中安装自己的orgDb包 2. 载入R包并大致查看一下R包的内容 可用keys（）命令查看一下这个包大致有哪些genes。 可用select（）命令查一...
1.首先安装eggnog-mapper软件 注释所需要的物种数据库网址如下，同时也可以用里面的脚本download_eggnog_data.py下载你所需要的数据库： egg...
原始数据是这样的 我要转换成如下的格式 只会的一条路转 在看完 《 R for data science》后的方法记录，来源于`章节 19`` 第三种
