最近抽空整理了以前写的函数,规范tinyarray包,反复检查和优化,调整了好久,终于得到下面的check结果 今天把他提交到CRAN了(是提交不是接收哈,没有那么快)整理了...
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#LncRNA从入门到精通[https://mp.weixin.qq.com/mp/appmsgalbum?__biz=MzAxMDkxODM1Ng==&action=get...
转自个人微信公粽号【易学统计】的统计学习笔记:R语言pec包深度验证Cox模型[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzU4MjgyODQzNw...
@小刘刘刘 可能是GSE的问题,有些GSE是要去原始数据提取的
GEO数据库学习总结(一)数据下载非常感谢jimmy大神与生信技能树一直以来的无私分享,自己学习的同时也伴随着记录,如有错误的,欢迎大家指正~~~~ 1.数据下载 Ⅰ、R代码直接下载数据 建议以Rdata形式...
画PCA输入矩阵,分组 可以多个分组
常用数据库 ID 序号ID 示例ID 来源一GLA, GLB, UGT1A1HGNC Gene Symbol(基因的官方名称)二ENSG00000116717Ensemble...
当时重新按照R 的时候不小心点了中文,报错的时候经常显示中文报错,但是很不利于我们去谷歌检索,这行代码可以解决
打扰您一下,代码里面相关性和P值是cor.test(),请问这和皮尔森相关系数计算区别大吗?
R计算mRNA和lncRNA之间的相关性+散点图我们在做表达谱数据分析的时候,经常需要检测基因两两之间表达的相关性。特别是在构建ceRNA网络的时候,我们需要去检查构成一对ceRNA的mRNA和lncRNA之间的表达是否呈...
这个算法的网站有一句话“Plot displaying the ESTIMATE score for each sample under Affymetrix platform against background ESTIMATE scores for all the samples defined under Affymetrix platform.”,我个人的理解是,平台之间对于样本背景有着不同的定义,可能有时候数据总体上差别不会很大,但是还是有存在影响个性的因素
ESTIMATE 算法 与 肿瘤纯度介绍 恶性实体瘤组织不仅包括肿瘤细胞,还包括与肿瘤相关的正常上皮和间质细胞、免疫细胞和血管细胞。基质细胞被认为在肿瘤生长、疾病进展和耐药性中起重要作用; 浸润性免疫细胞的作用...
简介 交互式绘图工具, 提供python, R, js接口, 以R接口为例 api类似, 需要注意在参数中涉及子项的在R中使用列表, 在python中使用字典 支持管道符操作...
测序上游分析系列: mRNA-seq转录组二代测序从raw reads到表达矩阵:上中游分析pipelinemiRNA-seq小RNA高通量测序pipeline:从raw r...
确实这个R包用法非常简单,大部分的都是卡在下载部分 直接代码下载 Github下载zip后本地下载 下载后可以直接用了,trans_exp一键转换