虽然没有几个关注,但能看到这些笔记的应该都是同志们 有时候朋友的私信我可能看不到,我也不一定能解决。 群体遗传学方面、生信方面、R语言等等,如果大家有什么问题,可以在这边留言...
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随着测序技术的普及和组装技术的完善,物种基因组版本更新很快。如果我们手头的数据是使用老版本基因组分析的结果,可以使用现成的工具直接转换(转换会有一些失败和错误的风险)。之前给...
从vcf文件中得到样本名 查看vcf文件中的样本数量:
1、Read depth Read深度:一个样本测序得到的reads数;容易和基因组测序的覆盖度 (多少基因组区域被测到了)和测序深度混淆 (单个核苷酸被测到的次数或所有核苷...
今天是新学期和甜甜的小媳妇儿的第一次约会。小媳妇儿给我准备了新衣服,让我这个在科研苦海苦苦挣扎的人枯木逢春,灿烂了一回呀。放个照骗,纪念一下吧嘿嘿。 江汉路的衣服,才是我们俩...
1.bed 排序 第1列按照染色体编号进行排序,排序后应该是chr1, chr2, chr4, chr5, chr10, chr20, chrX. 使用-V 第2列和第3列按...
今天根据NC大作1143份籼稻测序数据进行callsnp操作记录 1-下载SRA文件 prefetch --option-file SRR_Acc_List.all.txt ...
MNN来源:Batch effects in single-cell RNA sequencing data are corrected by matching mutual...
多细胞 1、多细胞是怎样产生的?2、为什么要去除多细胞或若是不去除多细胞对后续分析有何影响?3、去除双/多细胞是在分析的哪一步进行,质控前还是质控后?4、列举去除双/多细胞的...
搞个linux呗
python中下载scrublet包---doublet检测Win + R 打开运行窗口,输入cmd回车,打开命令行窗口 找到pip安装路径。image.png Python2/Python3安装路径是相同的,都在C:\Python ...
在单细胞数据分析中,在确定细胞类型后,除了可以进行差异表达基因分析外,还可以针对单个细胞类型进行分析特定分析,这时就需要我们提取细胞子集分开处理了。 一、Seurat数据格式...