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2003年12月，临床医学Ⅰ系、Ⅱ系，护理系及成人教育处分别易名为第一临床学院、第二临床学院、护理学院以及成人教育学院。

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2004年5月，我校临床医学、医学检验两个专业被评为广东省高校名牌专业。

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2005年5月21日，我校召开了第五次党代会，提出了学校的办学定位是：立足广东、辐射华南、面向全国；以本科生教育为主体，积极发展研究生教育；以医学学科为重点，多学科协调发展；...

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教育部评定我校本科教学工作水平为优秀

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2005年12月，我校被评为广东省文明单位。