可视化使用基因组浏览器来可视化区域的染色质景观。Integrative Genomic Viewer查看器提供了易于使用的web应用程序版本和本地桌面版本。UCSC基因组浏览...
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可视化使用基因组浏览器来可视化区域的染色质景观。Integrative Genomic Viewer查看器提供了易于使用的web应用程序版本和本地桌面版本。UCSC基因组浏览...
bulk转录组最主要的作用就是根据基因表达的变化找到其中蕴含的通路机制常规的GO和KEGG分析，属于超几何富集算法，使用的基因数据源是我们根据实验组vs对照组所获得的差异基因...
写在开头：在表观遗传学领域，染色质免疫沉淀（ChIP）是研究蛋白质（转录因子、组蛋白修饰等）与染色质相互作用的传统方法，可以分析特定蛋白在整个基因组上的分布情况。但是由于Ch...
前面进行了上游分析，接下来将在R中进行下游分析。Bulk RNA-seq最主要的下游分析就是进行差异基因表达分析，所以这一部分只讲解标准的下游分析流程。 首先读入数据 进行差...
写在开头：在这一个合集中，我将详细介绍bulk RNA-seq实际数据分析的流程，有哪些注意的地方以及一些小技巧 首先是获取测序数据：如果是自己的测序数据，直接从公司给的账号...
写在开头：R提供了各种具有分析数据与强大作图功能的工具包。对于没有计算背景出身的生物学家来说，相比于各种复杂的编程语言，如java、C语言等，R语言是非常友好的，R语言的语法...
这一部分我将讲解awk、grep、sed三个文本操作的强大利器，三个命令基本都是以正则表达式为基础。在数据分析过程中，我们通常需要提取出符合条件的文本、修改文本以进行后续分析...
写在开头：我曾经跟过各种视频教程详细学习Linux的系统使用，各位老师讲解得也非常详细，但很多内容对于我一个初学者来说非常晦涩难懂，并且很多实际的测序数据分析过程也用不到。我...