pudding815

以大设施anlei01环境为例 1、配置miniconda软件 2、设置环境 建立一个RNA-seq分析环境，这样是为了和其他环境区分开，以免本环境损坏造成其他环境也异常，也...

月底花

跟着官网[https://yezhengstat.github.io/CUTTag_tutorial/]学习CUT&Tag数据分析，参考：protocol[https://w...

单细胞指南

这篇文章我们将介绍从geo数据库下载单细胞测序数据后，多种数据格式多样本情况下，如何读取数据并创建seurat对象。 本文主要结构： 一、数据下载 二、数据读取与seurat...

梦蝶蓝天宇

先记录一下，我安装过程的惨痛经历😭，希望小伙伴们避免像我一样入坑。起初每一次安装，不论是使用conda还是pip工具，发现安装好的CellphoneDB（4.0.0）在she...

云养江停

Seurat standard pipeline(10核心流程) 创建Seurat对象 Read10X CreateSeuratObjecet 质控 Perc...

pudding815

一套H3K4me3的数据，GSE167940，单端single，无input!!有了！一翻邮件交流发给我了 一套H3K27ac的数据，GSE165809，单端single，有...

FengSL

时间序列研究的是基因表达的动态行为，测量的是一系列和时间点之间有强烈相关性的过程。和针对某一时间点的基因表达进行差异分析不同，时间序列更加关注是发现基因表达的趋势，以有助于理...

纵纵纵小鸮

使用DEseq2循环做多组间差异表达分析 当有多组RNA-seq数据时，有时需要对多个组合进行差异表达分析，例如当我有CIM0/CIM7/CIM14/CIM28四组时，我需要...