刘小泽写于19.12.29 + 2020.1.1这一篇不扯别的，只列我认为比较重点的limma包的知识，所以代码部分可能比较多。但也会用不同的知识点来区分 前言 limma的...
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刘小泽写于19.12.29 + 2020.1.1这一篇不扯别的，只列我认为比较重点的limma包的知识，所以代码部分可能比较多。但也会用不同的知识点来区分 前言 limma的...
如何使用deeptools处理BAM数据 总体介绍 deeptools是基于Python开发的一套工具，用于处理诸如RNA-seq, ChIP-seq, MNase-seq,...
在实战之前，首先对CHIP-seq分析做一些了解，以下是从各个地方copy过来综合起来的，有些散乱，是我认为重要以及应该了解的知识点。chip-seq 实战就跟在转录组和外显...
在实践之前，我先查找了一下有关组蛋白修饰的知识点：（参考文章：//www.greatytc.com/p/8aca72809c5c） 组蛋白修饰能预测染色质的类型（异...
RIPSeeker clp 17 June, 2020 RIPSeeker: 用于从RIP-seq实验中识别蛋白质相关转录本的统计R包 RIPSeeker使用具有负二项分布概...
系列笔记基于达澈生物讲座视频，从中初步学习了解生信分析中常遇到的组学分析技术。ChIP-seq和 CUT&Tag、CUT&RUN讲座视频笔记 - 简书 [https://w...
关于查找motif，目前有很多种软件可以进行预测。我所在的实验室通常使用FIMO（MEME套件里的一个），但是有很多文献里也提到了HOMER这个软件，并且不乏一些影响因子很高...
这是CUT&Tag数据分析的最后一部分，这一部分基本就是进行各种的可视化了。 第七节 可视化 通常，我们感兴趣的是使用基因组浏览器在各个区域可视化染色质landscape。I...
在开始笔记之前我只想吐槽一下，官网里这一部分的代码错的离谱！！！各种报错报的我怀疑人生。。。 第四节 比对结果过滤和文件格式转换 （一）利用比对质量过滤比对上的【可选步骤】 ...
