一. GWAS与群体结构 (1)群体遗传结构:群体水平大尺度遗传差异,亚群水平等位基因频率差异,不同祖先来源,个体间亲缘关系,家系等不同的群体结构。 图1 群体结构类型 (2...
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一. GWAS与群体结构 (1)群体遗传结构:群体水平大尺度遗传差异,亚群水平等位基因频率差异,不同祖先来源,个体间亲缘关系,家系等不同的群体结构。 图1 群体结构类型 (2...
1、GWAS 流程 image.png数据质控• 1)按分型百分比条件过滤,多数文章剔除缺失率在20%以上的位点,样本量较大的群体中,可以将缺失率小于50%的位点都保留;• ...
转录组研究揭示盐碱胁迫下的分子调控机制 中国土壤的盐化与碱化成分复杂且程度各不相同,植物在长期进化过程中,从分子、细胞、生理生化水平等各个层面,形成了相应的机制来应对盐碱的胁...
什么是bioinformatician 如何你想成为一名生信人,那么至少你需要了解什么叫做生物信息学。否者,朝着错误的方向再努力也是白费劲。 什么是生物信息学呢?在陈铭主编的...
这是我2022-02-16在CGM分享的文字稿 从2016年,我开始自学生物信息,那个时候,为了加深自己学习,所以就不间断的在网上分享我的学习笔记。 我有一个自己的博客,xu...
基因-共线性的定义与常见算法原理 物种内的共线性分析文件准备(物种比对到自身的.blast文件,物种基因信息文件.gff文件),运行MCScanX,输出collinear和t...
网站地址:http://www.phylogeny.fr/[http://www.phylogeny.fr/] 从2008和2010年发文章以来到现在,坚持这么多年,挺了不起...
基因组的序列提取,详情请看我之前的教程://www.greatytc.com/p/211a262aebc4 基因家族的鉴定-基于windows系统上的本地blast...
写在前面 以前总看到问题是,基因结构可视化的问题;现在则变成了启动子元件的预测或者说可视化。这本身比较简单,也比较玄乎,所以我一直不是太乐意与别人讨论。但学院今天断网,手上的...