动机 通常在单细胞RNA测序数据中观察到文库之间测序覆盖率的系统差异。它们通常是由细胞间的cDNA捕获或PCR扩增效率方面的技术差异引起的，这归因于用最少的起始材料难以实现一...
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动机 通常在单细胞RNA测序数据中观察到文库之间测序覆盖率的系统差异。它们通常是由细胞间的cDNA捕获或PCR扩增效率方面的技术差异引起的，这归因于用最少的起始材料难以实现一...
现在回想单细胞项目的一些常规分析，clusters/groups间的差异表达分析（differential expression analysis）几乎是分析必备项，Find...
单细胞分析不可避免的会涉及到鉴定不同细胞类型的功能或比较相同类型在不同状态下的功能差异，因此，功能分析在单细胞分析中相当重要. 功能分析的方法很多，这儿我们主要讲述3种功能分...
DE 比较不同的DE分析工具 bulk RNA-seq，现在最流行的就是DESeq2 和 edgeR。对单细胞测序数据来说，通常需要先聚类之后把细胞群体进行分组，然后来比较不...
今天跟大家分享的是2020年1月发表在Genome Biol.（IF：14.028）杂志上的一篇文章A benchmark of batch-effect correctio...
轨迹分析系列： 单细胞之轨迹分析-1：RNA velocity[//www.greatytc.com/p/ee0f7a8e6a06] 拟时间序列分析（Pseudot...
介绍：//www.greatytc.com/p/63071b368be5[//www.greatytc.com/p/63071b368be5]安装：注意：...
安装加载相应的包 If you don't have velocyto's example mouse bone marrow dataset, download with ...
