导读 前面我们已经整合了高质量的细胞，现在我们想知道细胞群中存在的不同细胞类型 ，因此下面将进行细胞聚类分析。 学习目标 描述评估用于聚类的主成分数量的方法 根据重要的主成分...
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导读 前面我们已经整合了高质量的细胞，现在我们想知道细胞群中存在的不同细胞类型 ，因此下面将进行细胞聚类分析。 学习目标 描述评估用于聚类的主成分数量的方法 根据重要的主成分...
.rds和.rda（.Rdata的简称 ）文件都可用于以R本机格式存储R对象。 1. 与非本机存储方法（例如write.table）相比，此保存方法有多个优点： 更紧凑，读取...
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参考： 发现AB区室 09 science Comprehensive mapping of long range interactions reveals folding ...
学习摸索了很久，在中文网没有找到很理想的带领小白入门三维基因组学的专题内容，因此在学习的过程中想把这写内容记录下来，希望对后来的像我这样的学生能够得到一些帮助。 随着Hi-C...
概念 FDR，Q value，adjust p valuep-value：衡量一次检验假阳性率的指标（False positive rate） ；q value：衡量错误发现...
陈巍学基因-illumina测序原理官方-illumina测序原理步骤：一、sample prep（样本准备）：基因文库制备（一个基因组切断再加接头）二、cluster ge...
Shell 脚本一直以来不是很入门，很多时候就是用到再查，发现自己有几个重复用比较高的点，还是记录一下，至少查的时候能少费点功夫~~ 1. for 循环 （1）列表for循环...
一、技术原理 基因组研究的维度可以分为很多种，例如下图所示 其中Hi-C是研究三维结构的一种方法。Hi-C技术源于染色体构象捕获（Chromosome Conformatio...
