一、序 目前对蛋白基因家族进行分析主要有两种方法，一基于同源性，二基于HMM模型。想要通过HMM模型预测蛋白基因家族，首先得需要HMM模型数据。HMM模型可以从Pfam数据库...
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一、序 目前对蛋白基因家族进行分析主要有两种方法，一基于同源性，二基于HMM模型。想要通过HMM模型预测蛋白基因家族，首先得需要HMM模型数据。HMM模型可以从Pfam数据库...
@恰好_fcc2 rmOutToGFF3.pl genome.fa.out > genome.fa.out.gff3 #使用RepeatMasker提供的rmOutToGFF3.pl 工具将结果转化为gff3， 但是需要注意，这里的gff3不是标准的gff3
rmOutToGFF3.pl , 是Repeatmasker 软件包里面有的脚本
RepeatModeler安装及使用细节参阅RepeatModele官方文档：http://www.repeatmasker.org/RepeatModeler/RepeatMasker和RepeatModel...
！！!分享篇使用RepeatModeler2.0＋RepeatMasker 的时候，严格按照命令跑程序，出现结果不如我意代码： 出现的结果： 我想要的结果 原因：repeat...
RepeatModeler已更新，拥有了一些新的功能，可以识别LTR的结构在基因组注释中第一步就是重复序列的屏蔽，目前常用的从头注释pipeline就是RepeatModel...
今天安装软件时，发生报错，经过查询，可能是之前安装过这个软件，但是不成功，部分文件下载一半就结束了。软件在conda用不了时，可clean一下重新安装 所以将这些下载了一半的...
情况说明： 在安装Ubuntu18.04的系统时，不小心将内存分区了，导致根目录只用了其中的一个区，后面没有内存用了，不想重新装系统，遂想方法解决 解决方法 1.合并分区 ...
原文地址：http://www.360doc.com/content/18/0127/20/19913717_725596003.shtml[http://www.360do...
Title：Demography and its effects on genomic variation in crop domestication 原文链接 背景 ： 超...
一、下载安装Aspera Connect Linux系统下的Aspera Connect安装（Windows下的Aspera Connect安装参考）。查看最新版本的Aspe...
MCScanX一般是做基因组之间的共线性 一、MCScanX安装 MCScanX官网http://chibba.pgml.uga.edu/mcscan2/#tm下载MCSca...
1.安装包 软件使用： ClustalW 提供了两种操作方式：1、键盘交互的菜单界面2、命令行方式由于命令行模式参数比较长，看起来也比较复杂，我们主要介绍键盘交互的菜单界面运...
