![240](https://cdn2.jianshu.io/assets/default_avatar/3-9a2bcc21a5d89e21dafc73b39dc5f582.jpg?imageMogr2/auto-orient/strip|imageView2/1/w/240/h/240)
@eason_devin 我同样遇到这个问题,好像是igraph从1.2.1版本后就移除了GLPK的调用,不能使用这个函数了,不知道怎么解决
细胞间通讯教程|| cellphonedb 及其可视化细胞配受体通识以及常见细胞分泌信号通路[//www.greatytc.com/p/df4721d29a91]CellChat:细胞间相互作用分析利器[https:/...
作者:ahworld链接:R函数实现单细胞StackedVlnPlot来源:微信公众号-seqyuan著作权归作者所有,任何形式的转载都请联系作者。 上图这样的单细胞Stac...
作者:ahworld链接:生信工程师的自我修养来源:微信公众号-seqyuan著作权归作者所有,任何形式的转载都请联系作者。 scanpy中的单细胞堆叠小提琴图一般是纵向的,...
@周运来就是我 感谢老师解答!
scRNA-seq拟时分析 || Monocle2 踩坑教程拟时(pseudotime)分析,又称细胞轨迹(cell trajectory)分析,通过拟时分析可以推断出发育过程细胞的分化轨迹或细胞亚型的演化过程,在发育相关研究中使用频...
老师您好,感谢您的单细胞系列教程!
在这篇教程中我有一个疑惑,在函数GM_state中,T0_counts <- table(pData(cds)$State, pData(cds)$seurat_clusters)[,"0"]的意思选取的是cluster为0的细胞,为什么您说是识别包含时间为零的大多数细胞呢?
希望大神解答我的疑问,谢谢!
scRNA-seq拟时分析 || Monocle2 踩坑教程拟时(pseudotime)分析,又称细胞轨迹(cell trajectory)分析,通过拟时分析可以推断出发育过程细胞的分化轨迹或细胞亚型的演化过程,在发育相关研究中使用频...