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    ENCODE ChIP-seq数据 | 从下载到分析

    很久不见。错过了很多的询问和回复,很抱歉。这段时间在整理我的第一篇paper,大部分涉及的东西不太具有可分享性(其实也是应该记录的)——————...

  • 环状DNA (eccDNA)分析学习笔记

    最近在学习当下很火的环状DNA(eccDNA)的建库技术以及生信分析,特此记录。 No.1 去低质量&去接头 这一步需要注意的是低质量碱基的qu...

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    如何统计测序文件的reads长度分布

    记录今天学会的一个小知识:统计测序文件的reads长度分布 由于某些原因,需要统计reads长度分布对建库方法进行质控,对测序数据进行可用与否的...

  • 单细胞测序分析学习笔记

    这一笔记的主要目的是记录学习和实践过程,所写皆尝试过为可用操作,看到的各位小伙伴有更好的操作欢迎随时交流~ 1. 创建 R 4.0以上的con...

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    喜欢的音乐记录

    发现年纪越大越容易不记得事情,以前记在本子上,收藏夹里的回忆都因为找不到本子、换了电脑而丢失,再想回去看看时,几番寻找都再得不到。凡此过往,皆为...

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    科研实验成功指南 | 低浓度质粒真的包不好慢病毒吗?

    今天要记录一个很实用的实验技巧:如题,怎么利用低浓度的质粒包好慢病毒吗? 慢病毒已经成为目前生命科学领域一个很常用的进行基因表达调控的实验方法了...

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    生信-单细胞分析 | scATAC分析踩坑记录

    课题需要某一篇已发表文章的基于10x Genomics平台的scATAC-seq数据,于是乎,开始了踩坑指南。 No.1 数据下载 众所周知,公...

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    Neuronscience | How to choose correct brain cell lines for your research

    今天这篇笔记主要是记录一些查找的脑细胞系相关的资料。 接下来需要进行一些细胞系的实验,因此在查找合适的已经建好的能够在体外培养的human br...

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    科研实用技能 | 运用软件分析snp,indel等之后如何设计引物进行验证呢

    最近在做一批样本,是基于大规模基因组测序寻找新的疾病相关突变位点(snv)和indel等的。 软件给出的结果一般都是以下形式,给出的只有突变所在...

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