为什么有些人总是能发好几篇纯生信SCI?因为人家掌握了方法,例如利用同一份GEO数据可以发两篇SCI,具体操作如下: 第一篇纯生信SCI可以这样做: 第一步,数据下载处理、合...
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①下载TXT文件和平台文件 若数据平台文件无gene symbol 和探针序列or GBlist,则无法注释。 ②ID转换 1.平台文件有gene symbol 平台文件改名...
本文是对WGCNA英文说明文档的翻译,英文的请查看这里[https://horvath.genetics.ucla.edu/html/CoexpressionNetwork/...
上节我们已经知道samtools view命令可以用于转换sam与bam文件类型,其实samtools view还可以用于提取与过滤比对结果,下面让我们了解一下。 数据地址[...
m6A作为最丰富的RNA修饰,是目前研究最多的课题之一。m6A修饰是一个动态/可逆的过程,由一系列的writers,erasers和readers(WERs)调节。不同的WE...
biomart是一个R package,能够完成基因注释的工作。在我得到差异表达基因之后,可以直接使用该包直接注释。 网络上许多代码已经过时,特此更新用法。 1 安装 2 p...
在分析表达谱芯片的时候,我们经常会遇到多个探针对应同一个基因的情况。一般遇到这种情况,最常见的两种处理方法是 1)取平均 2)取表达值高的那个探针 那么今天我们就用R来实现这...
差异基因的筛选方法 统计检验得到p值 比方说你想研究什么基因,可以在全部都是肿瘤组织里面以某个基因分类,分成高表达和低表达的两组,两组数据进行不配对t检验或者anova方差分...
前面给大家介绍过了 ☞R批量预测miRNA和靶基因之间的调控关系-ENCORI篇[https://link.zhihu.com/?target=http%3A//mp.wei...