一、在线工具 在线地址:https://www.md5ma.com/md5-calculator 二、Windows11查看文件的MD5值 在 windows 的命令行窗口,...
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一直说比对之前要去接头,那么我们去的接头是什么样子的呢?我一开始以为就是在待测序的reads加上一段碱基顺序已知的序列就可以了,后来发现 情况和我想象的不大一样。怎么回事捏?...
目录 前言 bamCompare 工具1.1 工具原理1.2 使用说明1.3 使用实例 bigwigCompare 工具2.1 使用说明2.2 使用实例 前言 今天主要介绍下...
参考: 「r<-包|ggplot2|grid」ggplotify——连接各类R图形R神包export的使用 缘由; 最近使用ChIPseeker 对peak进行了注释,画一个...
已知Gencode的注释文件(gtf和gff3)都是带“chr”’的,UCSC带“chr”,ENSEMBL不带“chr”,NCBI最新的甚至不带染色体号(建议摒弃NCBI的,...
目前我们主要分析的数据还是二代测序的数据,也就是大家经常挂在嘴边的 NGS,而这其中最大的赢家应该算是 illumina 测序公司了,其经典的边合成边测序(sequencin...
前情提要 搞NGS,注释文件是我们经常需要用到的。但是不同的实验室偏爱的数据库各不相同,甚至同一个课题组的小伙伴都会选择不同来源的数据库。那么不同来源的数据库是否有什么不同呢...