生信石头

写在前面 一年前，我看到课题组其他成员在整一个“进化保守区块”挖掘的工作。说实话，觉得....挺麻烦。于是我写了一个工具，具体见推文《进化保守的基因区块-可视化挖掘》。 这个...

生信石头

写在前面 知道我的朋友，相信都有了解，元旦假期某晚凌晨，我突发起来，折腾了一个困扰我很久很久的问题，并解决了他。2015年，TBtools 开发之前，我写过一个 Blast3...

组学大讲堂

做科研的都知道开创性的工作自然意义重大，但那是可遇不可求。迅速跟进大牛们开创性的思路或者方法，结合自身的研究基础，做出类似的成果无疑是个高效的策略。 早些年的转录组可谓是典型...

组学大讲堂

最近，小编看到这样一种说法“基因家族分析类文章已经过时了，很难再发SCI了”。这是真的么？答案当然是否定的！闲暇之余，小编搜索统计了2020年截至到今天的基因家族分析文章的数...

正踪大米饭儿

一般使用 CMplot 绘制SNP密度图：包链接：https://github.com/YinLiLin/R-CMplot 要绘制 SNP 密度图，仅仅需要三列即可：a. 第...

斩毛毛

根据已有的蛋白库，对从基因组上提取到的蛋白序列进行比对，从而获得相应的信息。 常用的数据库： Nr：NCBI官方非冗余蛋白数据库，包括PDB, Swiss-Prot, PIR...

果蝇饲养员的生信笔记

之前有一次，我导说“能不能把这些基因按顺序画在果蝇的染色体上”，因此，我寻找了一些实现这个需求的方法。经过一番奇奇怪怪的操作之后，最终用ggplot2画了。。。其它方法简单地...