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我每次想下载类群OrthoDB数据库就找不到那个链接太费劲了 这次我记录一下怎么找 https://busco.ezlab.org/[https://busco.ezlab....
陈连福老师的安装流程[http://www.chenlianfu.com/?p=2323]MAKER in Yandell Lab[http://www.yandell-la...
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参考:终端命令神器--Screen命令详解[https://zhuanlan.zhihu.com/p/405968623]。 希望程序保持终端命令行界面,让程序在终端上持续输...
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直系同源基因(orthology)是指在进化上起源于一个始祖基因并垂直传递的同源基因,分布在两个或两个以上的物种的基因组中,功能高度保守且结构相似,能够相互替换,并具有组织特...
生物灭绝事件生物历史上出名的几次灭绝事件,具体时间和名称如下: 奥陶纪-志留纪大灭绝(Ordovician-Silurian extinction event)时间:大约4....
整个流程是使用氨基酸序列进行分歧时间推断。 输入文件准备 符合paml格式要求的phy 如果格式不符合要求可以使用trimal自带工具制作符合要求的文件。readal -in...
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问题出发点在于,cds中终止密码子出现在中间的情况。推荐解决方案:蛋白序列中*替换为X 中间一个终止密码子坏了满锅汤,在这种情况下还要完成blast、mafft、transl...
操作一摸一样?氨基酸序列吗?
rgene_gamma计算2023-10-02rgene_gamma计算,准备如下两个文件,以及ctl配置文件 树文件:请注意,根节点需要一个简单的化石校准,比如“@4.5”(450Ma ago)。如果没有这个标记计算出...
tqdm会显示一个进度条,描述为"Processing items",单位为"item",并遍历items列表,同时显示当前处理的项。
论文 Drivers and trends of global soil microbial carbon over two decades https://www.natu...
如上所示,处理序列过程中很容易遇到序列名与位点信息混合的文件。对于异常1,比较好处理,>序列名换到下一行就行了,但是异常2就比较麻烦了。为了批量处理所以准备了,一个pytho...
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国际年代地层时间 国际地层委员会https://stratigraphy.org/chart[https://stratigraphy.org/chart] 国际年代地层图2...