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  • 为什么您assoc后,有A2呢?

    GWAS分析-说人话(9)初尝关联分析禁果

    前言 OK,这里只是初尝关联分析,有很多参数上的设置,及说明 请参考其他文章(有空会在最下面补上)。 书接上一回(GWAS分析-说人话(4)合并数据),当我们整理好了一个合并...

  • 可怕,我居然连写2篇随笔。(我的OTU和ASV还静静躺在草稿里)

  • 写了一半从实验室回家了 后半段似乎不够一气呵成。
    不过,不影响中心主旨。哈哈哈😃

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    我想做个理想主义者

    昨天(6.17)是一年一度的生日。一如既往,要进行一番自我思考、自我剖析。 缘分妙不可言 本科毕业4年,硕士毕业1年,9月即将正式入学读生物博士。8年前,高考结束的那一刻,我...

  • 您好,想问一下,我在vcf转换成map,ped文件时候,报错,line 23969 of .vcf file has fewer tokens than expected, 您遇到过吗,2号染色体,转不下去了

    基因型数据与1000G merge后做PCA看人群分布

    写在前面,对于生信新手来说,不熟悉代码的基础,总是空中楼阁一般,想搜一条代码、做一些适合自己数据的运算更是难上加难,踩过的坑总要填,为了新手们不要像我一样浪费时间在这苦恼的代...

  • 基因型数据与1000G merge后做PCA看人群分布

    写在前面,对于生信新手来说,不熟悉代码的基础,总是空中楼阁一般,想搜一条代码、做一些适合自己数据的运算更是难上加难,踩过的坑总要填,为了新手们不要像我一样浪费时间在这苦恼的代...

  • 自建图书馆

    很久没有写东西更新这个生活相关的标签了。目前在挪威生活了快半年,学习了挪威语,工作上也接触了新的领域。另外希望自己仍然保持日常读书的习惯。但是我慢慢发现,很多书,我读过了,记...

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    UKBB数据集下载流程(第二节)

    很久没有更新,被老板抓走做别的去了。 主要数据集下载 阅读使用手册上,会有一些field,bulk, individuals这样的词,比较难以对应网站上的标签。下面我来讲解一...

  • 我没有用过网页版的,是不是国内不能啊?

    TwoSampleMR 遇到的坑

    第一次尝试医学统计常用的MR,我选择了比较多用的R包,TwoSampleMR, 这个包还有一个webApp -- MRbase.所有流程基本和网上可以搜到的一样,这里推荐这个...

  • 想问下作者,GUI生成的热图什么的怎么保存呢?

    02—甲基化芯片的一般分析流程

    什么是甲基化芯片?一文了解 MethylationEPIC 850K 甲基化芯片 简而言之,是基于亚硫酸盐处理后的DNA序列杂交的信号探测。亚硫酸盐是甲基化探测的:金标准“,...

  • 您好,想问一下您用这个跑过EPIC的数据吗

    ChAMP包学习(4)

    9. Gene Set Enrichment Analysis 基因集富集分析是生物信息学研究的重要环节。在前面的步骤之后,已经获得了一些重要的DMPs或DMRs,因此我们可...

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    ChAMP包学习(4)

    9. Gene Set Enrichment Analysis 基因集富集分析是生物信息学研究的重要环节。在前面的步骤之后,已经获得了一些重要的DMPs或DMRs,因此我们可...

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    GWAS imputation

    GWAS imputation是什么? Genotype imputation 是运用连锁不平衡的原理依据一个高密度的参考基因组填补要研究数据的一种方法。 常用的参考基因组数...