加载所需R包 设置工作路径 构建测试数据集 将热图结果按聚类后的顺序输出
加载所需R包 设置工作路径 构建测试数据集 将热图结果按聚类后的顺序输出
由于太久没有分析过bulk数据了,前几天突然被要求分析一个文章的数据时有点乱了手脚,所以在这里想总结一下关于芯片数据与seq数据的差异分析流程。 假如你是小白,也刚刚了解NG...
事情起源于,某个吃了很多汉堡王一起学习的日子,技能树一众学徒一起学习从GEO数据挖掘到limma差异分析等等等。 选的数据集倒是很有、趣。随便画的热图是这样的👇(已经很整齐均...
说在前面 在国内做生信的小伙伴或多或少都听过一个大名鼎鼎的名字---Y叔,想当初小编初入生信大门时还专门百度查了一下,他就是南方医科大学生物信息学系主任余光创教授。Y叔在国际...
1. Seurat对象查看当前的Assay 在进行了SCTransform操作后,矩阵默认会变成SCT矩阵,如果不加设置,后续的PCA等操作都是基于SCT矩阵。修改Defau...
使用corrplot包绘制相关性图 加载所需R包 基本使用 使用示例
加载所需R包 构建测试数据集 使用Heatmap函数绘制热图 使用HeatmapAnnotation函数构建注释对象 使用add_heatmap函数组合多个热图或注释信息 r...
图形装置(Graphics Devices)x11(), windows() 打开一个绘图窗口plot.new() 为绘制新图形结束当前图形窗口dev.set() 指定图形窗...
27. 序列logo图绘制 清除当前环境中的变量 设置工作目录 使用seqLogo包绘制序列logo图 使用ggseqlogo包绘制序列logo图 使用motifStack包...