1、富集分析的背景知识 - 简书 (jianshu.com)[//www.greatytc.com/p/0b938d0e652c]2、clusterprofile富...
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AUC允许在单细胞rna数据集中识别具有活性基因集(如gene signature,gene module)的细胞。AUCell使用曲线下面积来计算输入基因集的一个关键子集是...
单细胞绘图系列: Seurat绘图函数总结[//www.greatytc.com/p/95e61f7e834d] 使用ggplot2优化Seurat绘图[https...
相关原理详细介绍生信技能树详解GSEA[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzAxMDkxODM1Ng==&mid=2247507922&id...
VCF (variant callformat) 文件记录了所有样品基因组中所有位置变异(主要包括SNP和InDel)信息。后续几乎所有分析内容都是基于此文件,如进化树分析、...
一.软件下载安装 🔸bwa:https://github.com/lh3/bwa[https://github.com/lh3/bwa]安装及命令详解参考:http://st...
写在前面:今天突然想写这个教程,花了一下午看资料,其实我前面是有一些基础的,但是看的还是会很乱,所以想把这个包的脉络写一下,希望能够可以跟大家讨论一下并且自己以后使用这个包的...
0_1 前言 有时间再详细写introduction。先把我分析数据的流程记录下来,后续持续更新。 0_2 用到的软件或脚本 测序数据质控:fastp[https://git...
双细胞是指由于实验原因,在单细胞微流控等流程中某个液滴中含有2个及以上的细胞,而在同一个液滴中的细胞在后续分析中带有相同的Cell Barcode,从而会被认为是一个细胞的伪...