发简信
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根据rawdata算出来FPKM，然后进行单个基因与其他基因之间相关性的计算 转置后文件内容为：纵坐标是样本名称，横坐标是不同基因的Ensembl 这样就算好了基因间的相关性...
如果你觉得GO或KEGG不够解释，或许可以试试GSEA 具体内容参考这篇[https://blog.csdn.net/weixin_45822007/article/deta...
1. 先准备好外显子 参考这篇[//www.greatytc.com/p/4afbdc8fd8ed] 2. 因为我的rawdata基因名字是symbol，所以需要名...
@Aji 无重复样本可以看看我写过的两篇 GFOLD摸索 和 CORNAS摸索
RNA-seq摸索：4. edgeR/limma/DESeq2差异基因分析→ggplot2作火山图→biomaRt转换ID并注释请一定看这里：写下来只是为了记录一些自己的实践，当然如果能对你有所帮助那就更好了，欢迎大家和我交流 差异分析流程: 1 初始数据 2 标准化(normalization)：D...
参考这篇 基本操作都差不多~[https://zhuanlan.zhihu.com/p/99842799]工具：Fiji（包含更多插件的ImageJ） 个人感觉比普通的Ima...
参考这篇：拿到基因表达矩阵之后的那点事(三)[//www.greatytc.com/p/985672e00585]DESeq2详细用法[https://www.ji...
参考这篇 但是参考文章里这两句语句↑在R升级后已经不能这么写了，改为↓ 然后运行 但是我运行后一直在loading，遂放弃😶 所以我还是选择了网页版，时好时坏吧
一：合并文件 目的是：合并两个文件解决方法：用merge合并两个文件，通过相同的列名Gene_Symbol 生成的文件会在原本的列名后加上.x、.y区分原来属于哪个文件.x表...
我之前写过一篇用R中pheatmap画heatmap这篇实践一种交互式的方法 iheatmapr参考这里：iheatmapr包：可交互的热图绘制方法——生信宝典iheatma...
参考这篇ID转换不用怕，clusterProfiler帮你忙这篇详细讲了无参考基因组该怎么办，值得一看 简单介绍一下几种常用的ID：Ensemble id：一般以ENSG开头...
从我写的RNA-seq摸索：4. edgeR/limma/DESeq2差异基因分析→ggplot2作火山图→biomaRt转换ID并注释中提取出来这部分，方便以后修改补充 参...
试试 BiocManager::install("biomaRt") ？
RNA-seq(7): DEseq2筛选差异表达基因并注释(bioMart)============================================写在前面：可以参考另外一篇《得到差异基因后怎么做？[https://www.jians...
