嘿嘿嘿嘿哈

本节概览：hisat2 + featureCounts:获取hisat2索引文件，hisat2比对和samtools格式转化，featureCounts计数得到counts表...

果蝇饲养员的生信笔记

一、 基本介绍 Salmon是一款新的、极快的转录组计数软件。它与Kallisto和Sailfish类似，可以不通过mapping而获得基因的counts值。Salmon的...

JeremyL

在基因组调控元件分析中，HOMER 可以用于发现新的motif。HOMER 通过比较两个序列集，再使用ZOOPS scoring (zero or one occurrenc...

尹小奥

在R语言上安装R包的时候，总是会遇到安装报错，其实很多时候都是因为R语言版本和R包版本不匹配导致的，这时候就需要自己手动安装R包了，查了好多网页文章，方法很多很杂，现在来总结...

尹小奥

DiffBind包现在更新了，但是我还是习惯了用旧的版本，由于我的R语言更新到了4.0，默认安装DiffBind的最新版本，所以我又下载了R语言3.5版本，安装上DiffBi...

六六_ryx

前言 ATAC-seq/ChIP-Seq中重复样本的处理ATAC-Seq要求必须有2次或更多次生物学重复（十分珍贵或者稀有样本除外，但必须做至少2次技术重复）。理论上重复样本...