导读 上一篇:宏基因组分箱(一)Megahit组装和QUAST质量评价[//www.greatytc.com/p/41f7d6134c0d]。分箱工具有很多,我为什...
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Kraken和Kraken2(Kraken的迭代版本)是微生物组分析中最常用的软件,与其他同功能的软件相比,在速度快的前提下,准确性也很高。那么,Kraken究竟是如何做到的...
前言 一般生物信息分析流程都包含很多的分析步骤,这些步骤之间的联系也有很多情况。例如,流程的步骤中有不少是依赖上一步的结果,同时也有些步骤之间没有联系可以同时进行,还有的...
在日常工作中常遇到这样的情况,我们需要一个监控线程用于随时的获得其他进程的任务请求,或者我们需要监视某些资源等的变化,一个高效的Monitor程序如何使用python语言实现...
--------------- Nickier 2018-12-21 --------------- samtools是一个用于操作sam和bam文件的工具合集。能够实现二进...
部分摘自# VincentLuo91的博客 Part 1 VCF格式的学习 1.什么是vcf?VCF是用于描述SNP,INDEL和SV结果的文本文件。在GATK软件中得到最好...
文章来源 //www.greatytc.com/p/38f734ae47f5 天秤座的机器狗关注 0.92018.08.03 14:52*字数 2060阅读 213...
vcftools是用来处理vcf和bcf文件的工具集,功能涵盖了过滤,数据格式转换,一些指标的统计计算,vcf文件之间变异信息的差异比较等等。 1.基本用法 2.使用 官网提...
在用于存储reads比对结果的SAM/BAM格式提出之后(2009年),用于存储变异检测结果的格式VCF( variant call format )也被提出(2010年),...