| UPARSE—力挽狂澜 微生物群落研究最常用的方案莫过于扩增子研究（16S、ITS等扩增子测序技术），通过扩增群落样本基因组特定区域片段，实现对样本所包含的物种进行分类学...
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安装请看 https://www.rdocumentation.org/packages/philentropy/versions/0.7.0#Examples[https:...
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参考https://blog.csdn.net/sixtyfour/article/details/80354164?utm_medium=distribute.pc_rel...
**JSON (JavaScript Object Notation) 数据格式，官方的说法是“一种轻量级的数据交换格式。 易于人阅读和编写。同时也易于机器解析和生成“。 我...
Perl程序一行命令，可以替代grep+sed+awk； 一行式选项-e 表示后面接perl的一行式表达式； -p 表示print操作，即对每一读入的行在经过表达式操作后都默...
所有网络，包括生物网络 biological networks、社交网络 social networks、技术网络（例如计算机网络和电路）等，都可以用图的形式来表示，这些图中...
导语 模体（motif）是一个对初涉复杂科学的人来说，相对陌生的概念，但它却是复杂网络研究中最有力的工具之一。2002年的 Science 论文“Network Motifs...
通俗解释机器学习中的召回率、精确率、准确率，一文让你一辈子忘不掉这两个词赶时间的同学们看这里：提升精确率是为了不错报、提升召回率是为了不漏报 先说个题外话，暴击一下乱写博客的...
UK Biobank 是指通过标准化流程，收集并长期储存人体生物样本（如血液和 DNA）及样本采集对象生理、病理、社会经济信息的资源库，本质上也是一种大样本的人群前瞻性队列研...
UK Biobank是目前世界上规模最大的人类遗传队列样本库，它收集了50万名来自英国40-69岁志愿者提供的共1500万份样本，旨在研究遗传因素、环境因素、生活习惯等与人类...
3.4 微生物数据组成分析 早在1897年，皮尔逊就警告说，在器官测量中使用两个绝对测量值的比值，可能会形成“伪相关”。自1920s以来，地质学的研究人员已经知道，使用标准的...
中科院的周宁一老师，2013年在AEM杂志发表文章（IntragenomicHeterogeneity of 16S rRNA Genes Causes Overestima...