Hayley笔记

生存模型的构建方法包括：1. Lasso回归；2. Cox多因素回归；3. 随机森林；4. 支持向量机 可以把log_rank_test或cox筛选出的基因单独做模型构建，也...

Hayley笔记

免疫组库基础知识见：单细胞免疫组库：TCR基因重排原理和TCR测序建库方法[//www.greatytc.com/p/c4896ffadc46] scReperto...

Hayley笔记

SCENIC官网：https://rawcdn.githack.com/aertslab/SCENIC/701cc7cc4ac762b91479b3bd2eaf5ad5661...

土豆干锅

一、scMetabolism的安装 scMetabolism是一个R包，用于在单细胞分辨率下量化代谢活性，目前只适用于物种是人的单细胞数据。作者推荐使用seurat的数据进行...

单细胞空间交响乐

hello，大家好，今天周一，做一个简单的汇总，主要针对基因集打分，无论是单细胞还是空间，基因集打分都很普遍，方法也很多，我们来总结一下。 研究背景 在单细胞转录组测序中，整...

Hayley笔记

单细胞富集分析系列： 单细胞之富集分析-1：单细胞GSEA分析流程[//www.greatytc.com/p/00f069cb239c] 单细胞之富集分析-2：批量...

Davey1220

简介 scRepertoire包是由华盛顿大学的Nick Borcherding博士开发，是一款针对10X V(D)J数据的免疫组库分析工具。它可以直接读取10X cellr...