参考网页:https://blog.csdn.net/weixin_43551076/article/details/112197355[https://blog.csdn....
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跑一个程序的时候遇到报错The error message "Model too large for size-limited Gurobi license" or "Mod...
参考链接:https://pypi.org/project/intervaltree/[https://pypi.org/project/intervaltree/]安装: ...
fataqc后可能需要对reads进行过滤看文献总结一些相关软件fastqmcf (v1.0) TrimGalore 参考//www.greatytc.com/p/...
最近看到一个做PCA分析比较好的包factoextra,在此纪录一下。factoextra生成发表级PCA主成分分析图 别人的简书https://www.jianshu.co...
数据框转granges对象官方网址https://kasperdanielhansen.github.io/genbioconductor/html/GenomicRange...
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MetascapeStatistics for Enrichment Analysis | Metascape Blog[http://metascape.org/blog/...
isoseq3官网:但是后面有polish这一步IsoSeq/isoseq-clustering.md at master · PacificBiosciences/IsoS...
参考网址:https://www.ndsu.edu/pubweb/~mcclean/plsc411/Pacific%20Biosciencs%20CCS%20vs%20CLR...
findOverlaps findOverlaps - 简书 (jianshu.com)[//www.greatytc.com/p/6842308edec4] fi...
和chip seq实验流程比较 chip seq分析流程 Cut&Tag实验流程 参考网站:解锁新技术,玩转表观研究-CUT&Tag (baidu.com)[https://...
pipline参考:https://bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/ORFik/inst/doc/Ribo-...
在ncbi找nanopore三代数据的时候,首先熟悉一下ncbi数据的整理的规则。参考网址:GEO数据库下载 - 百度文库 (baidu.com)[https://wenku...
首先参考一下gatk官网:https://gatk.broadinstitute.org/hc/en-us/articles/360047232772--Notebook-I...
找到两个参考网站,也有一些迷惑的地方,我用的第二个网站这里主要讨论上游分析,下游分析网站中也有对应的脚本,但是这里不过多讨论网站一:https://docs.gdc.canc...
跑完全基因组前面的pipline,拿到了vcf文件根据指示把vcf转化为maf,进一步画图统计,使用vcf2maf vcf2maf的git地址为: GitHub - mskc...
2022年3月science发出一系列了关于这个参考基因组的文章 但是怎么下载呢 参考网址: 截至2022年5月,目前的版本有v2.0,v1.1,v1.0等等 因为这个测是一...